mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTACATTTTGAAACGGAGGGA CCTCTGTTTCAAAATGTAGGT ACCAATTCTTTAGATGATACTCCCTCTGTTTCAAAATGTAGGTTGTTTTGGTTTTTTTAGGTTCATAGTGTTTGCTAAGCATCTTTATATAACATATATGTCTAGATACATAGCAAAATATATGAATTTAGAAAAGTTTAAACGACCTACATTTTGAAACGGAGGGAGTACATAGAGTGTCTTGGA GGACCAATTCTTTAGATGATACTCCCTCTGTTTCAAAATGTAGGTTGTTTTGGTTTTTTTAGGTTCATAGTGTTTGCTAAGCATCTTTATATAACATATATGTCTAGATACATAGCAAAATATATGAATTTAGAAAAGTTTAAACGACCTACATTTTGAAACGGAGGGAGTACATAGAGTGTCTTGGAATACTTAAAATGTCTCCGTACAAACATGTGGAAAACAACAACACCATACATGCATCCCATTTTATTCGAGAAGAAACGTGATTGCAATTATCTATCGATCTTGGGTCTCCATGCATCTCAGTCCCTGAAGAAACCAAGTGACGGGTTGACGACGGAGGAGCCGCCCTCGACGAGCAGGTTCTGCCCGCTCACGTACCGGGCGTCGTCGCTTGCGAGGAAGAGCGCCGCGGCGGCGATGTCGTCCGCCTTGAGCCCCACGCCCTTGAGGTTCGCCGCGCCCTCCAATG 0 0 3' arm Panicum_virgatum mirnest MIR1122 0.0000007 osa-MIR806c 0.0000006 -77.6 .((((..(((((..((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((...(((((((...((((.((((((...))))))...))))...)))))))...)))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....)))). (-77.6)