mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAATGGAGTGAGGTGCAACA TTGCACCTTGCTCCGTTGTGG ACTTGGGTAAATTTCACTCTGCCCTCTGCTGTTCAGCATGGTTTTGCTTTGCCACCACGATGTTCATTTTCATTGCACCTTGCTCCGTTGTGGTATTGATGTTCTGCGGAAGGGAGTCCCTGTATCAAGGAATTGTTACATGGATGGCTGCTGACGCCGCCCATTGTCATGCATGGCACTGTGCCACTAGCTTGATACGCTTGAACTGTATGTTTTATCGCATACGAACATAAATGCATCGACATTGTGGCAGTTATTTGATACAGAGACTCGCAACTGTAGGACAAAATCACAATGGAGTGAGGTGCAACACAATGAACAATATGGTAGCAAAGTGAAAGTCTGTCGAGCTGCCGGGGACACAGTGAATTTTATCCAACT AGAACAGGTCATCCTGGTCTTGACCAATGAAGGCCTTATTTACTTGGGTAAATTTCACTCTGCCCTCTGCTGTTCAGCATGGTTTTGCTTTGCCACCACGATGTTCATTTTCATTGCACCTTGCTCCGTTGTGGTATTGATGTTCTGCGGAAGGGAGTCCCTGTATCAAGGAATTGTTACATGGATGGCTGCTGACGCCGCCCATTGTCATGCATGGCACTGTGCCACTAGCTTGATACGCTTGAACTGTATGTTTTATCGCATACGAACATAAATGCATCGACATTGTGGCAGTTATTTGATACAGAGACTCGCAACTGTAGGACAAAATCACAATGGAGTGAGGTGCAACACAATGAACAATATGGTAGCAAAGTGAAAGTCTGTCGAGCTGCCGGGGACACAGTGAATTTTATCCAACTATTTGTATGTTGTTTTCTGATTGAAACCATTAAGTAATTATGAATAAGCTGCAAGAGTCGGTCATAGCACAAATGCATGTAGTCATCGCCACATTTGGCGTCACCGTGTGTTATTGTAACATTTGTACCATTTGTTGTGTATCATTGTAACTGTGAGATACAAATATTATAAAACATCTGTATCTGTT 2 0 3' arm Panicum_virgatum mirnest 100 osa-MIR1875 0.00000008 -151 ..(((((((((.((((((.((.((((.((.((((.(((.(((((((((((((.((((...((((((((....((((((((((((((((((((((.(...((((((((((....(((((.((((((((((.(((((((((((((.((((.......)))).))).((((((((((((((...))))...(((.......)))((...(((((((......)))))))..))...)))))).)))).)))))))))).)))))))))).)))))....))))))))))).))))))))))))))))))))))...))))))))...)))).))))))))))).))))).)))).)).)))).)).)))))).))))))))).. (-151)