mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGAATGACTTGCCTA GGCAAGCATTCTGGTTAAG GTGTTGGTGAGGGAGGGAGGCCTTACATGGTGATGAAGAGCCTATCTCCCTTAGCCAAGAATGACTTGCCTATCTCTACTATTTGGTTCATCTGGGAGCCCTTATGATGGATGAAAGGTGGATGGGCAAGCATTCTGGTTAAGCGAGTGATTCTCTTCCACCATGCTAGGCTAACCCTCTTTCTAATCCTA GAAACCAACAAAGCTACGGGCATATGGCATTGGCAAACAAGTGTTGGTGAGGGAGGGAGGCCTTACATGGTGATGAAGAGCCTATCTCCCTTAGCCAAGAATGACTTGCCTATCTCTACTATTTGGTTCATCTGGGAGCCCTTATGATGGATGAAAGGTGGATGGGCAAGCATTCTGGTTAAGCGAGTGATTCTCTTCCACCATGCTAGGCTAACCCTCTTTCTAATCCTAAGTCTGCACATCAAAGTTAGGTCATGTGTTTTGGTTGCATTTTTTTTAGCTCTTCCATTGGTAACAAAAGCCATCCAATTCATTATATATGTTGCAGTATTACATTATCTGTGTAATTGTTTGCTGTTTTTTTTTCTGCAGAAGATCTTCTCATCAGAACCAGCACTTCCAACAACATAGCAGCCAGTGAGCTCTCGACAATTTGGCCAACGGCGCCTGCTGCTGCTGAAATGAAGACAGTCTCTTTTCTTAGCCTTGGCCACATCATAAAGTCCTAAATGAGCAGTAAGGCCGGGCATACCTGAATGATGGTTGTGGTTGTAGCATACAGTTAGGGGGAAAACAACTTTGCGTTCTGTAACACTTGAGGATTTTAAATGAGGTTCGTGGTCTTCCCGGGGAAACGGATGATAGCGTTTATTTGGATCATGGGAGAAGCTTCTGAAGGATTAAAGATGACATTCTACTCTACTGGCGATGC 0 2 5' arm Panicum_virgatum mirnest MIR169_5 0.0007 osa-MIR1430 0.000000000003 -81.1 .....((.(((((((((.(((((..(((((((..((((((.....(((.((((((((.(((((.(((((((((((..(((.((((..(((((.(((...)))...))))).)))).))))))))))))))))))))))))))).))).....)))))))))))))..)))))..)))))))))....)).. (-81.1)