mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTTGTCCTTGGCTACA CTCTAATAACTGCCTGGGGGCCATGCAAGAAGGGGTAGAGAGTGGGAGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGCCACCACACCAGGCGTCAACATACGCCGGCATAATATGCATGATTATGGCCAAGGATCCCGGCCGGCAAGTTTGTCCTTGGCTACACCTTACTCTCTGCCTATCATGTGTTGCCCTTAATTACCTGGCTTGAGT CAGAAGAACTCGAGAGACCTCAAGGCCGGAGAAGGTAGCTGATAGCCTGAGATCGAAAAGCTATGCCTCTAATAACTGCCTGGGGGCCATGCAAGAAGGGGTAGAGAGTGGGAGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGCCACCACACCAGGCGTCAACATACGCCGGCATAATATGCATGATTATGGCCAAGGATCCCGGCCGGCAAGTTTGTCCTTGGCTACACCTTACTCTCTGCCTATCATGTGTTGCCCTTAATTACCTGGCTTGAGTGTAGCTGTGTATGTCCATGAACATTATTGAACATTACTCGGCGGCGGGGTAGGATTTCCTCCCATAGCTAGAGAGCATGCAAGAGGAAGAAGATCAGTAAGCGTGTCATAAAAGGTCCCATCCCTTCATGGAGTTAGGCTGCTACAACTACCTCCCACACTTGACAGGTAACACCCTTTCCATCCGAAAATTCGACTG 1 1 5' arm Panicum_virgatum mirnest MIR169_2 0.000000003 bdi-MIR169f 2e-19 -84.1 (((........((((((((((.(((((.((..((((((((((((((...((.(((((((((((((((((((((.((((...((...(((((......))))).((((...)))).))....))))...((...)).))))))))).)))))))))))).)).)))))))))))))).)).))))).))))))).......)))..))). (-84.1)