mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATATACTCCCTCCGTCCAACA TTGAAACGGAGGGGGTATAAAA GAATCTAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGGGTATAAAATAATTTACACATGATCAACGCTGGGTTGTTCTGGGGTCTGAAGATAGTAAATATGCCACTTCTCACAGACAAATCTGTGTCTATGCCTAAATAAAAGGATCACCCATATTCTTAATAAAATTTCTATGCTTAGACAAGAGTCTTCTACGACAGCAAACGAAACCTGTGAAGTGGCAACATGGAGGCTGGCAGCAAGGGCATAGCTTCACCAACCTAAGCATATACTAAGGAGGACGCCGCATATCAGCAGGGATCAAGCTAGCATGTAGTAAATATGACCTGTCAGTGAAACAAGACAGAAAAGAATCAGCATAGCATGTGAATACAGAACATGGAAGGAACTTTTTTAAAGGTGATTTCAACACAGTAGAATGAATAGAAGAGGTGTCTTACATGTAATCTGGAGATGAGAAGAGTAGTTAGCTAAGCAATTATACGATACCTTATATACTCCCTCCGTCCAACAAAAGATGTCGGAGTCGTAGT GAATCTAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGGGTATAAAATAATTTACACATGATCAACGCTGGGTTGTTCTGGGGTCTGAAGATAGTAAATATGCCACTTCTCACAGACAAATCTGTGTCTATGCCTAAATAAAAGGATCACCCATATTCTTAATAAAATTTCTATGCTTAGACAAGAGTCTTCTACGACAGCAAACGAAACCTGTGAAGTGGCAACATGGAGGCTGGCAGCAAGGGCATAGCTTCACCAACCTAAGCATATACTAAGGAGGACGCCGCATATCAGCAGGGATCAAGCTAGCATGTAGTAAATATGACCTGTCAGTGAAACAAGACAGAAAAGAATCAGCATAGCATGTGAATACAGAACATGGAAGGAACTTTTTTAAAGGTGATTTCAACACAGTAGAATGAATAGAAGAGGTGTCTTACATGTAATCTGGAGATGAGAAGAGTAGTTAGCTAAGCAATTATACGATACCTTATATACTCCCTCCGTCCAACAAAAGATGTCGGAGTCGTAGTTCATCGTGTATTTTGCAAAAAAAGTCCAGCGTATACTCAAAACAGTTCAGAATCTTCCTCCGAATTGCAATTTCAAGTTCGAGACTTGCCATCTCCATCCTCCCCCGCGGTCCGCC 4 1 3' arm Avena_barbata mirnest MIR1122 0.000002 100 -111 ((.(((..(((((((.....(((..(((((((((((((((((...))).((((((......(((((.((.(((((.(((.((...........)).))).(((.((((.((((..(((.((((((.((.(((((..((((((.......))))))......)))..)).)).)))))))))(((..(((((..(((....((..(((((((.(((((......(((((((...((....)).))))))).((..(((.((......)).))).))..)))))...))).))))..))..)))....))))).......))).)))).))))...))).))))).))..)))))....)))))).((.(((((((((.((((.((((((((....((...(((.((...)).)))...)).)))))))).)))).)))))..))))...))...(((.(((......(((....))).....)))))).)))))))))))))).)))...))))))).))).))..... (-111)