mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTGCGGCAGCCTCACT GGAACTGCCCAAGGGAACGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGAGTGATCACCGAGAGGAACGGAAGTTCGAGCTCTCATGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACTTCTTCCCGTCGTTGGGCA ATCTCTCTTCCTTGCCCATCTACTCGCGTCTCTATCTCTCTGTAGGTCTTGGAAGTTGCCATGTTCCTGTCTTCTCCCCTTCTTCCTTCCGTGCATAATCTTTGGTTTTTGAGATGCTACACATCAGGTTTCTTGATCCGAACCAGACCAGATCAGATCACGGAGCAATTTTCCAGCGGAAAGATTAAGGTAGCTGATCTTCAGGAATAAGTTTAGCAGCTTCTTAGATTCAGTGGCCATCGTCCCTTATTTCATAGAGATCCTTCCATCTCCGGTGTGCTTTTGGATCTAAGTTTTGGGATCTAAGCTTGAAGCTTCCATCTATCTGGTCATGGTATTTTATGCAATATATCTAGCCTGGAACTGCCCAAGGGAACGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGAGTGATCACCGAGAGGAACGGAAGTTCGAGCTCTCATGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACTTCTTCCCGTCGTTGGGCACAGCACGGTGATTGATTGCTGGGCAAAGCAGGTAGTGCCAATATTTTTTTATTTCTCCCAGCGTTTGATTGATTCCCTGCATTTCTTGGTATGAATAGTAATTCTGATTGTTTCACTATACTTGTTCGATCCTTGATGAGCAGTTTCCTTGTGTTAACTGTATATATATCGGCTTGTTTATCGATCTTACCACTTGATGTTTATTTTTGAGAACCAGTTTGTTGGTTCCGATAGATTCATTATTGCTCAAAGGTCTATGCTAGTGTCAGGTCTGAATAGTGGTAGATCAAATATTGGTAATTCTGATTGCTGATGGTGCATTCCATGGCTTCATTTAAGTCTAATGCTTGGAACCGTGCTACTTTCCTGCTGAATTTTGACTCGCGGTACCTACGACACAGT 1 2 5' arm Panicum_virgatum mirnest MIR167_1 4e-32 zma-MIR167d 2e-34 -72.1 .....((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((.....(((((((..(((((((((....))))...))))).))))))).....)))))))))))))..)))))).)))))).)))))....))))))) (-72.1)