mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTCATGCTGTAGTTTCATCT GTGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTAGCGGTGCTCCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTTACCTCGATCTCCTCCTGATCGCCGAGGACGAATTCAGGATAGGGGAAAGAGGAATAATAAGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGTGCACAACGA GGGTAGCGGTGCTCCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTTACCTCGATCTCCTCCTGATCGCCGAGGACGAATTCAGGATAGGGGAAAGAGGAATAATAAGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGTGCACAACGAAAACCCTAGCCGAGAATTGCATCCATGCATCAAACCATCGGTGGGTGTCTTCAGGTCAGTTCTTGCAAAATTCGTGCTGCAACTACGGGATCAGATATGGTGACATACAGATCAGATGTAGGTGTATGGAGAGCAGATCAGCTCAAGTTTATTCCTCAATTCGAAGCTGGTTTATTTTCTGAATGTTCTGCTAATTTCTTGTTTTGCGCTTTTCGTTCTCTCTTTTCCGTTCAGTTCTGCAGAGAGCGTACTTAGAATTTTTGGGTTTTCATTATAAATCTGTTCTAATTATTTAATTTGCATCTTCCATATAGTATTCCTTTAATTTTATTTCTACAACTAGTTTACTCTCTCTCTCCGATCCCCTCTCTCTCTCTAGTCTCTAAGAACGAACAGAGATGAACTGATCCTGTACTACTAGACCCTGAATCCTAGTGGTGTTAGCATGAAATTATTCCACTTAATTGGAATCTTGATATCTTTGGCTGAATTGAATCGATACTTGAACTGTGCCTTAGTTTGCACACATGAG 1 1 3' arm Panicum_virgatum mirnest MIR167_1 0.00000000000001 sbi-MIR167e 4e-17 -67.6 .......(((((((((.(((.(((((((((((.((((((((((((..........(((((...((((..((((((((((((((.......)))..))))))..)))))..))))......)))))))))))))))))))))))))))).))).))))).))))..... (-67.6)