mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC GGGTAGCGGTGCTCCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTTACCTCGATCTCCTCCTGATCGCCGAGGACGAATTCAGGATAGGGGAAAGAGGAATAATAAGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGTGCACAACGAA GGGTAGCGGTGCTCCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTTACCTCGATCTCCTCCTGATCGCCGAGGACGAATTCAGGATAGGGGAAAGAGGAATAATAAGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGTGCACAACGAAAACCCTAGCCGAGAATTGCATCCATGCATCAAACCATCGGTGGGTGTCTTCAGGTCAGTTCTTGCAAAATTCGTGCTGCAACTACGGGATCAGATATGGTGACATACAGATCAGATGTAGGTGTATGGAGAGCAGATCAGCTCAAGTTTATTCCTCAATTCGAAGCTGGTTTATTTTCTGAATGTTCTGCTAATTTCTTGTTTTGCGCTTTTCGTTCTCTCTTTTCCGTTCAGTTCTGCAGAGAGCGTACTTAGAATTTTTGGGTTTTCATTATAAATCTGTTCTAATTATTTAATTTGCATCTTCCATATAGTATTCCTTTAATTTTATTTCTACAACTAGTTTACTCTCTCTCTCCGATCCCCTCTCTCTCTCTAGTCTCTAAGAACGAACAGAGATGAACTGATCCTGTACTACTAGACCCTGAATCCTAGTGGTGTTAGCATGAAATTATTCCACTTAATTGGAATCTTGATATCTTTGGCTGAATTGAATCGATACTTGAACTGTGCCTTAGTTTGCACACATGAG 0 1 5' arm Panicum_virgatum mirnest MIR167_1 0.00000000000001 sbi-MIR167e 4e-17 -67.6 ........(((((((((.(((.(((((((((((.((((((((((((..........(((((...((((..((((((((((((((.......)))..))))))..)))))..))))......)))))))))))))))))))))))))))).))).))))).))))...... (-67.6)