mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCATGCTTTGCAGTTTCATC TATTTGGTGCATCCTCTAGGAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGACGAGTGTTTAGCTAGTTGTCCACAGAAGTGATGACTGCTAACGATCAGATCATGCTTTGCAGTTTCATCTGCTCGTGGGTGCACAACAG GCTCGCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAATTTTTATTTGGTGCATCCTCTAGGAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGACGAGTGTTTAGCTAGTTGTCCACAGAAGTGATGACTGCTAACGATCAGATCATGCTTTGCAGTTTCATCTGCTCGTGGGTGCACAACAGAGATACTTCGTCGGTGTGCAAGGGTAATTCACAAATTTCTCTCGCAACAGGTGATTCTTTCGTGCTTTTCCGTAGTTTCTTGGAGTTTCATGGTGTCGGCGGCCGAGCATCAATCGGAACACCAAACAGACAATTCGAATTTCAGGTGAAATGAACAGCACAGATACCTTCTTTTCAATTTCGATTTCATCCTTCCATGGCTTGCATTGTTGATGCCCTGAAGCTATCTTCCCCAGCTGCTTTTCCTGCTTCACTTATATGACTTGGAGATTTCTTTTCTTTTTTTTAGACCAATATGACTTGGAGGTTTTTGTAGTGGTATTATTATTGTGTCTTAGATTGCTCTCAAGAAGCTATGCATGAGATCATTAATTGGAGTGAAACCTGTTCGTTCTTGGAGCCGGATATGTCAGTCTACTTTGAGTCCC 1 1 5' arm Panicum_virgatum mirnest MIR167_1 0.000000000008 bdi-MIR167c 1e-16 -56.5 ......((((((((.....(((((((((((((.((((((((((((....((((.(((.(((((((.((....)))))))))))))))).))))))))))))..)))))))))...))))..))))))))..... (-56.5)