mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCAAGTTTATAGAAAAA TTTCTATAAACTTTGTCAAAT GAGATTGTTTTAGCTTTGTCCTAAGTCAAACTTCTTTAGCTTTGACCAAGTTTATAGAAAAATACATATATATCTTCAATATCAAACTAGTTTCAGTAGATAGACCCATGAAATATATTTTCATGGTGGCATTATATTTGATATTTTAGGTGTTAATATATTTTCTATAAACTTTGTCAAATTTAGACATGTTTGACTTGGACAAAGCTAATACAACCCC AGTTAATGAAGATTGCAAAGACATACAACTTGGCGGTAATTTGCCTATCATGTTTATGAAGGGCGCGCACTTGTGATGCAGCAACTACCGTCATGTTTCTTTTCTTTTGTACAGATTTTTAGTTCATTTTCCCACTAAAGGTCATCTACGGTTAAACTAGTGAGAAAGAGAAACCCCACCTTCTGAACTGAACTTGATTAGTTATATGATGTATGAATTTCATAAAAACCAAATGTCTGAATTGCTAAGCTAACTATCTTATTCTTTCTTCAAATTAAAGATGATTGTATGTTTAGGTAAGTAGGTAGAGATTGTTTTAGCTTTGTCCTAAGTCAAACTTCTTTAGCTTTGACCAAGTTTATAGAAAAATACATATATATCTTCAATATCAAACTAGTTTCAGTAGATAGACCCATGAAATATATTTTCATGGTGGCATTATATTTGATATTTTAGGTGTTAATATATTTTCTATAAACTTTGTCAAATTTAGACATGTTTGACTTGGACAAAGCTAATACAACCCCATTATTTGGAGCGGAGGGAGGAAGGATTTTAATGAGGCTATCAGACTTATCATCTTGTTTTGTTGAGCAGGTTGTCTTGTTGAACCAAGTCACTACTAAATTTACAGAAGGATCATTTCAATTGACTCTTGCTCTAGGTGACAGCTGGTCCCACTCGTGCACAAATCGACTGATTCTGTACTGGAATGGGAATGATCGGTATGCATACCTGGACAAATCTCCTTCACTTCCAGTAGCTTCAGCTCCATATGCAGTGACAGGCAAAGGGGTGAGGGATGCTGCGAGTTCAAATCACAAGAGAGTCCGAGTAACGTAGCGAACTTGGTGCCAACTCCTGTACCTCCAGTTCTCTACTATGCACTTGCTGCTAAATTAACTGCGTTCCTTCACCGTGGGTCTTTTGGACAAATTAGGTGATTGGTGGGTATTGGTAGAGAATCTCCTACCATTTTGAAAGTCTCGATTGCTTTTTGATGTAAACCAGAAATTGTAGGGAAGTAGATGCCGCAAAAGAGGGTTTAGTTGACCCATCGTCAAATCTCGTGTGTCTGAAACGCGACTACCAGCTCTTTCAGGTGGCTCGGACCTATTTGTTCGT 2 0 5' arm Panicum_virgatum mirnest 100 osa-MIR437 1e-17 -72.8 ....((((.((((((((((((.(((((((((...(((((.((((((.((((((((((((((.((.((..((((((..(((((((((.((((.(((..........((((((((.....))))))))))).))))..)))))))))..))))))..)).)))))))))))))))).)))))).)))))...))))))))))))))))))))).)))).... (-72.8)