mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTCTCTATCTGTCAGT GGGAGGAGCTGGGTTTTGAAGGTTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGTTTCTTAGCATGAGTGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGTCACTCATTAGGCCCATCACT CCTTCCCCCCTCTCCGCTCCTCTCCCTCTCTTTGGGTGCGTGTGCAATTGAAAAGTGACAAGCATGGTGATTTCTTGTGTTTGATTTTGTGTTTTCGTTCTGATCTTTCTTGAGCACCCAGAAATCCATGGTGTAGTTTCTTTCTGTTCAGGGCCATTTCATGCATGCTAGCACGCACACATCTATACAACTATATATAGCTAGACCAAAAGAAATTATTTAATGAGTCACACGAGGTCGATCTTCATGGTGCCTTAGGGTTTTTATTTGCAGTTTGCCTGAAAGGGAGGAGCTGGGTTTTGAAGGTTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGTTTCTTAGCATGAGTGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGTCACTCATTAGGCCCATCACTTCTTCCCCGCTAATATCTTACATGCGGATAGGATCTCTATGTCTTTTCTTCCTAAGTAATAACCAACACGATCTGATTCATGCATGATTTCTATTCATTTTTTTCTTGTAGGGAAACGATTGCAAAGCAAGCAATAATATTGATCAAACTTTCATCAGAGACGACTCTACATACGATAAAAAACAAGATTAGTGGTTGTGTTATTTCTCTATTTTTATTTTCCATTGTAATAAATTCCCAGTCATGTGGGTAGTGGTTGTGTTATTTCTCTCAAATAAGATGATTTTTAGGGTGCTTTCTAGC 0 1 5' arm Panicum_virgatum mirnest mir-156 2e-37 ssp-MIR156 3e-51 -58.4 ((...((..((((((((((....(((((((((((((((((((((.((((((....((((((((((.....)))))))))))))))).))))))))))))).))))))))....)))..))))))))).)) (-58.4)