mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGTCAAGGATGACTTGCCTA GGCGGTCACCTTGGCTAGT GATCAGTTGTAGGACGAAGGAAGAAGAGGGGTCTTCCATGAGGGCCATAGCCAGCCTTTGGTAGTCAAGGATGACTTGCCTACATGGCCTTGTGAGTCCCGGTTGCATAGCCGGTTCAGCTAGGTCTGTGGGCGGTCACCTTGGCTAGTCTGAGTGGCTTTTGCCTCTCATGGGAGGCTTCTTCTTCTCTGTTAGTCATGATATATA GGCAGATCAGTTGTAGGACGAAGGAAGAAGAGGGGTCTTCCATGAGGGCCATAGCCAGCCTTTGGTAGTCAAGGATGACTTGCCTACATGGCCTTGTGAGTCCCGGTTGCATAGCCGGTTCAGCTAGGTCTGTGGGCGGTCACCTTGGCTAGTCTGAGTGGCTTTTGCCTCTCATGGGAGGCTTCTTCTTCTCTGTTAGTCATGATATATATTTGCCTGGTGCTTCATTATATTTGCTTTGTCAGATCGGTCAGAAATACATGCGTTGGACACTTGGCCCTGCAAGTATGACTGGAATCACTTCTAACATTTTAATTTTTTTCTGTTGTTTTACTTAATGAGCGCTTCCTCCAT 0 2 5' arm Panicum_virgatum mirnest MIR169_5 2e-32 sbi-MIR169c 9e-34 -88.8 .((((..((...((((..(((((((((..((((((((((((((((...(((((..(((.(((((((((((.(((((.(((((((.(((((.(((((..((((((....)))))))))).).)))))))))))))))))))))))))).)).))))))))...))).)))))))))))))))))))))).))))...))))))..... (-88.8)