mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCATCA ATGAATGATGCTGCTGCTGCTG AGCTTTGGGAATTCTTTGTGGATGAGGGATGTAACGTTGCTGATGGTGATATTGTTCAACTTCATCATCATCATCATCATCATGTGAATACGATGAATGATGCTGCTGCTGCTGGTGATGTTTTGCCGGTTCAGTCACGTCACATACCCTACCATGCTTCTTTTGTTCCTTG GATAGGTAACTCTTTTCATTCATTCATTGACACTCCACGCGAGAAACTTAACAATTAAAGATAGATACTTAATTTAACCCCTCTAAGGATGTTGGATTAACAGTACAAAATAAGTAAGTCATTAAGAACAACCTCTTGAAATTAACTTAACTTAATTAGAGACTAATCTATTAAATTAAGTAACCACCTATATATTTCTATAAGTATATTAAACCTAAAATTAAGCTTTTTCTTTCTTCTTCTTCAGTTTCAAGCAGCACAAGTGGGTACTAATCATGAGAAGAATCCAAGCATTTTGTTTCTTTTAGGTTTGTAGAGAAGTTCAGGTGGGATTTTGTAAAGATCTTCATCAACAGCTTTGGGAATTCTTTGTGGATGAGGGATGTAACGTTGCTGATGGTGATATTGTTCAACTTCATCATCATCATCATCATCATGTGAATACGATGAATGATGCTGCTGCTGCTGGTGATGTTTTGCCGGTTCAGTCACGTCACATACCCTACCATGCTTCTTTTGTTCCTTGATACTAATATTGTTCTAGTCTCGAGTTTTTTTTTTTTGCAAAATTAAGTTTTTTTTCATTTCCATTTGGTAAAAAGAAATACATTGAAGAAAGAAAGAAGGCTAATATCTGATG 5 1 5' arm Papaver_somniferum mirnest mir-598 0.0002 bdi-MIR156b 0.0005 -49.6 ......((((((....(((((...((((((((.((((.(((((.(((((.((...(((.((.((.((.((.((((((((((..........)))).)))))).)).)).))..))))).)).)))))...))))).)))).)))).)))).)))))........)))))).. (-49.6)