mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCGGTTCAATAAAGCTGTGG ACGGCTTTCTTGAACTGCATG TAATGGTGCTCTTTCTATTCTTCCACGGCTTTCTTGAACTGCATGGGTTTTGATCTGTCAGATCTGTGTTTTTTTATATAATCTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATAGAGACAGTATCAAA CAAACTGTCTGTTTCATAAACCCTAATTAGGGTTTCCATGAAAAAGATTTGTAGATCTGAAAAACATCCATAATAATGGTGCTCTTTCTATTCTTCCACGGCTTTCTTGAACTGCATGGGTTTTGATCTGTCAGATCTGTGTTTTTTTATATAATCTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATAGAGACAGTATCAAAACCAGTAGATGCAAAAAAGTTGCAGTATTTCTTTATTTTGATTTGGTTTTCTTGATCTTTAGTTTCTTATTCTTTTTTTTTTTTTTAGAACGGCTAACAAATAAATCTCGAGCACTCTCGGAGTACCCACTGACAAAGGAGTACTCCGAGAGTAACCCGAGTCTACCAGTAATTTCACGCCAGTTCCCGGGGAAAACCCGCCGCCCGAAGGCCCACTACGGTAAAACTCGGCCCACCAGCAGCATTTTGCTGCCGGCAGGACTCGAACTCCTCACCTCCATAAGGGAAGCAAGGAGGGTACCACTCCACCATAAGGGGATTGGTTTTAGTTTCTTATTCTGATTTAGTTTCTTGGTTAAAGGTTTTGGTTTTGATTTATTATTATGTGAGTTCTATGTGTTTCGTCAAAGAACCAGGGATGTTCGTCGGTTCGGTTTATACAAATTTTATGTAACTGAA 1 0 3' arm Parthenium_argentatum mirnest MIR396 0.0000000005 ath-MIR396a 0.0000000001 -54 ...(((((((.((((((((.((((((((((((.((((((((((.(((((..(((((...)))))...............))))).)))))))))).)))))))))))).)))))))).))))))).. (-54)