mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTCCCTCAAGGGCTTCTCA AGAAGCCTTTGAAGGAGAATA TTTCCAAGGCATTGATTGTTTGCTCTCCCTCAAGGGCTTCTCACTTTGACCTACAATGACCATAACTCTAATCTGTATGTTTTGAGTCATGTTAGAAGCCTTTGAAGGAGAATAAAAAATCCATGTTTTGATT GACCAATGAGATCATAAAAAAAATAGTAGTAGTGTTTGCAAGGCATTGATTATTTGTTCTCCCTCAAGGGTTTCTGACATTGGCCATACAATGTCTTTAGTCTCATTAGTATGTTTTAAGTCGTATCAGAAACCTTTTGATGGAGAATAAAAAGTCATTGTTTTGATTGTATCCAATTAAATTTGTCATGATTTCGTGATCAATGGTATAAGAAGAAATTAAGAAGTGTTTCCAAGGCATTGATTGTTTGCTCTCCCTCAAGGGCTTCTCACTTTGACCTACAATGACCATAACTCTAATCTGTATGTTTTGAGTCATGTTAGAAGCCTTTGAAGGAGAATAAAAAATCCATGTTTTGATTGTGTCCGATACAATTTGTCACTCTTACAGGATGAGTGGGAAAAGAAGAAACTAAGAATGGTTTCTAATGCATTTATTCCTTGCTCTCCCTCAAGGGCTTCTAACTTTGACCATGCAATTCCTTTGTCTCAAAGGTATGTATTCAGACATTCAGTCGTCTTAGAAGCCTATTGAGAGAGAATAAAAAGTTGATGTATTGATATGATTTCAGTGATAAAGAGACTTGAACAACAATGGATAAGGTATGAACGCCATTATGTGTACTCTAC 3 0 5' arm Parthenium_argentatum mirnest MIR473 0.0005 aqc-MIR477f 0.000006 -46.9 ....((((((((.((((.((((.(((((.((((((((((((.((..((((...(((....((((...........))))..))).)))).)).)))))))))))).))))).)))).)))).))))))))... (-46.9)