mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGTACGTGCA CATGTGCCCGTCTTCTCCATC ACAAGATCTATGACGTAGGTGCTGATCAAAATGGAGAAGCAGGGTACGTGCATTACTAACTCATCATGAGAACCTTGGGTCAAGGTTCCTAACCATGTAACCTTGGGTTAAGGTTCATGTTTGTGACTAAGGATCGTGTACATGTGTGTTAGTGATTCATGTGCCCGTCTTCTCCATCATGACCACCTACACCTTAACATCAAAGA CTTGTACTGTCTTATGAACATGCACTACATTGTGCAGAGTTAAACACAAGATCTATGACGTAGGTGCTGATCAAAATGGAGAAGCAGGGTACGTGCATTACTAACTCATCATGAGAACCTTGGGTCAAGGTTCCTAACCATGTAACCTTGGGTTAAGGTTCATGTTTGTGACTAAGGATCGTGTACATGTGTGTTAGTGATTCATGTGCCCGTCTTCTCCATCATGACCACCTACACCTTAACATCAAAGATTACAAAGTTCCTACATTGCTACACTTTGAAGACTCGGACATATATGTAAGTCCCATTGTTAACAAAGATAAGGATTTTACATATTTGTTCCTCTTTATACTCATGCAAACATATAAAAAACCCATGTTTGATACACTTAGACCAAGCGTTGTGGAAGGGTGAAGGGTGGCGCGAGCCACCTGGCTTGCGTAGGTGGATCACGCACACCACAACTGAGTCGATCGAACGGTGGCGCGATCAGTGGCCCGCGATGGGGATCACTCCC 3 0 5' arm Parthenium_argentatum mirnest MIR164 1.0E-8 ptc-MIR164e 7.0E-10 -69.1 ......(((.(((.(((((((.((.(((..(((((((((..(((((((((.(((((((((....(((..(((((((((.((((((((...........)))))))).))))))))).(((.(((((.......))))).))).))).))))))))).)))))))))..)))))))))..))).))....)))))..)).))).))) (-69.1)