mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGGAGTACGATGATGATGAT GTCTTAAGTGTATTTTTCTA AAGGTGGCCAAGAGGAGTACGATGATGATGATGATAATGAGGGAAACGAGGAGGAAGAGGTTGAACATCCCGGTGAAGTCTCTATAGGGAAGAAGATTTGGACTTTCATCACCACATAGTGAAGACCTAAAAGACTGCGCGCTAGTTGCATGTCTTAAGTGTATTTTTCTAGGCATGTT AAGCCGTACCAGTAACTCCTGTAGAGGTCAGTGGTGGAGATAACGGAGAACTAAGAAACTCCGATGCTGGTCTTCCCGCTGTAGGCAATAGCCCTTCGAAGGATGCAGCAACTAACAATCAGGAAGTCAGTGCTGGCATAGCTAATGGATTGGTAGATGATACAGGGTCGAGCGAAGAAGTGAATGAAACACCGGAAAGGCCCTCAGCTCAGAGTGGGTACAACAACATGGGACACGAAGGTGGCCAAGAGGAGTACGATGATGATGATGATAATGAGGGAAACGAGGAGGAAGAGGTTGAACATCCCGGTGAAGTCTCTATAGGGAAGAAGATTTGGACTTTCATCACCACATAGTGAAGACCTAAAAGACTGCGCGCTAGTTGCATGTCTTAAGTGTATTTTTCTAGGCATGTTGACACATTTCTTTTGCTACCTTTAGAATAGTCCATGCTTTTAGAGTGTGTAGTGGTGTGTATTCTTCTTTAGTGGTTGGGCATTTGGGTAGTACCATTTTATGTTTGTGATTAGGATGTCAGGTGCTTGCATATTGTTTAACATAGTGTCCATAATATTGGCGTCACTATTTGACCAACGAAAATGTAACTCTAAATTTCCAGTTCTTAATGTCATTGAAACGATGTTT 5 1 5' arm Petunia_axillaris_subsp._axillaris mirnest mir-598 0.0007 bna-MIR166c 0.0006 -35.4 ......(((.(((((((((((.....(((.(((.((((...((...((.((......(((((..((.....((((((((((..((..........))..)))))....))))).....))...)))))......)).))..)).)))))))))).....))))))))))).)))..... (-35.4)