mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATTGCTTGTTTGTGTGCTGG AGCACAACAGCAAAAATGGA CTAATAATCACCATTGCTTGTTTGTGTGCTGGGGTAACAGAAAAATCAATAATCCCACAAAATTTTGGTGATACTATGAAAATGTAGAAGTAACTATTTATCATTTCATCTTCACTATGAAAAATTATTGATTATTTCTTACCAAGAAGTTAATGTAAGAACATCATTGAATATGAACCAAAAGGGATGCAGATTCTTACTTGTTTTCTAGCTTTTGTATTTTTCTACTTTCTTCCCATGCTTTGATTAGTGATAACCTCTTCTCAGTCGCAACTCTTGCAAGCACCGCATCTGAAAATAAATAAGGATGATGACATAATACAAAAGGGTTCATAAATGGAAATTAAATTTCATAATATCACATGACAAACCTCTGTTTACAGAACCCTCAGTTGGTTTTACTTCAGCAACTTCTTGAGTCTCTGACAATATAACCAAATTAACAATAATAAACAGCACAACAGCAAAAATGGACAGAAGTT GCTGTTTTCCCATGCTGAAATGGCTGAAAGCTTTTTATGTGCCCTGTTCAATAATTTCAGTTAAATTAGCATCCTAGACTTTGTTAACCTCAGAAATTTATAATATTCTCTGTCATTTTAGTTCTAATTGGAACCATTTTTTAACATAYRTGTTTCCAAATTGACCACCTTTATGATGGTGATATTTTACAATGAATGGTGTATATTTGGTTCCAAGAGTGTTCAATGCGCAAAAATAGCAAAGATCAGTACAAGTAAAAAAAGAAACCAACCAACAACATTTCAATTCAAAGATAAAAGAACATAAAGTTGATGTTAGGTTGATTAATCACCATGGTTAAGGTAAATCAATTTAAGAGTCTTAACAATTATTTGGCACAACAATGAAAATGATTCAACCCAACAAGATTTTTAGGCTAATAATCACCATTGCTTGTTTGTGTGCTGGGGTAACAGAAAAATCAATAATCCCACAAAATTTTGGTGATACTATGAAAATGTAGAAGTAACTATTTATCATTTCATCTTCACTATGAAAAATTATTGATTATTTCTTACCAAGAAGTTAATGTAAGAACATCATTGAATATGAACCAAAAGGGATGCAGATTCTTACTTGTTTTCTAGCTTTTGTATTTTTCTACTTTCTTCCCATGCTTTGATTAGTGATAACCTCTTCTCAGTCGCAACTCTTGCAAGCACCGCATCTGAAAATAAATAAGGATGATGACATAATACAAAAGGGTTCATAAATGGAAATTAAATTTCATAATATCACATGACAAACCTCTGTTTACAGAACCCTCAGTTGGTTTTACTTCAGCAACTTCTTGAGTCTCTGACAATATAACCAAATTAACAATAATAAACAGCACAACAGCAAAAATGGACAGAAGTTATGATCATAAATATGATGATGAAACAACAAAAGATTATTTTGTTGCAAACCATTGTTGGTCTGTTACTAAATGGCATGTAACTTGCTTCAATATTAACATTGATAGCAAATCAATC 4 1 5' arm Phaseolus_acutifolius mirnest 100 100 -82.6 ..........(((((..(((((..(((((((.((((..(((((((((((((((............((((((....((((((..(((((........)))))..))))))..))))))......)))))))))).))))))))).(((((.(((.(((((((((((.((.............))..))))....)))))))))).))))).(((((((((((..((.....((.(((......((.(((.(((((............)))))...((.(((.......)))...)).))).))...))).)).))...))))))))(((((((.((((((((.........((((........))))......))))))))..))))))).)))(((((.((..((((..((((...))))..))))...)).))))).((((....))))...)))))))..))))).)))))......... (-82.6)