mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGCGTCAATATCTCC AGGTATTGGCGTGCCTCAACC ATGATGAAGAAGATCGAATAGGAGGTATTGGCGTGCCTCAACCTGAAAACATGGTTATATGTTTTCACAACCATGCTTTTGGATTGAGCCGCGTCAATATCTCCTTCGATGACAAAACACAGG GGGAATTCCCGGGGATGCATTTGGAGCCATGCAATTACAGCAACCTGCAGGCTGGTTCTTGTTGCAAAGTAGTCTAGTGAGTTCTCTCTTAACAAGCATGGATGAAGATGATGATGATGATGATGATGAAGAAGATCGAATAGGAGGTATTGGCGTGCCTCAACCTGAAAACATGGTTATATGTTTTCACAACCATGCTTTTGGATTGAGCCGCGTCAATATCTCCTTCGATGACAAAACACAGGTGGGCCAAAGCATTCTGTGCACGAGGTTCGATCATTGATGCTTCAAAGTCAATGTAAGAAAAGGTATCAAAGTACCTATCATGACAAATTGGTTAACCAAGTACTTAGTACAAGGATATGATTACAAATAAACTGGATTCAAGAATAACCCAAAAAAAAAAAGTTAATTAATACGAC 1 0 3' arm Phaseolus_acutifolius mirnest MIR171_1 0.000002 sbi-MIR171h 0.0000004 -45 ............(((((..((((((((((((((((.(((((.((((((.(((((((............))))))).)))))).))))).)))))))))))))))))))))............. (-45)