mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGCCAAGAATGACTTGCCCG CGGCAAGCATTCTTGTCCCGG GTTCGTGTAGCGTCTCGTATGTAAAGGTAGAGCGTGTTACTCGGCCAAGAATGACTTGCCCGCATCCTGTCGTGCAATATGGTTGCACATACACATTACAGTCTGCCCGGCAAGCATTCTTGTCCCGGCATCGCTCTCTTCTTTTCATGCCGGGCCCTGCATGACG GCTTCATCGCTTCCTCTGGGATTCATTACCTGTTAGATCTTATGCAGTTATTAATTCTTCTGAATATGAAGTTCGTGTAGCGTCTCGTATGTAAAGGTAGAGCGTGTTACTCGGCCAAGAATGACTTGCCCGCATCCTGTCGTGCAATATGGTTGCACATACACATTACAGTCTGCCCGGCAAGCATTCTTGTCCCGGCATCGCTCTCTTCTTTTCATGCCGGGCCCTGCATGACGACGGCGTTGCTTTTACATGTCAGATCATGATCATGGTGTTCACGTCTCAATACCATTCGTTGCGTTGCTTCTCATGACGACGGCGTTGCTTCTCAATACCATTCGTTGCGTTTTCTGCTCCAGTTCGGTATGCAAGTTGTTCAGGTCTCTTCGTTCACATATCGCCATTGTCATGGATTATAATGGGTGGAAGTATCTTCAATATTATCAATATGATAAGCCAATAATCTATGACGTTGTGGTGTACAAAATATCAAAGAATGGATTCATGGGCTTCTAAGCCTATACTCAATTTTACTACTGGTACATAGTGCGTCAAGAGGGAAAAATGAATTCCATTTAAGTATAGTGCGTCAAGAGGACAAAATGAATTCCATCTAATTGAACATAGATTTCTGCGTAGTTTCTGCTTTGCAAAATGTACCCATATTATCACACGTTTAAACTCTGCATGTGTTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3 1 5' arm Picea_engelmannii_x_Picea_glauca mirnest 100 100 -62.4 ..((((((((.((((.(((((.(((((.((((((((((....((.((((((((.((((((.(((..((((.(((((((...))))))).........))))..)))..)))))))))))))).)).)))).))))))..))))).))))).)))).)))))))).. (-62.4)