mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGAATGACTTGCCCG GGTAGGTTGTTCTTGGCAAAG ATTCGTGTAGGCTCTTGCATGTAGAGGCCGAGAGTGTTACTCAGCCAAGAATGACTTGCCCGCATACTGTTGTGGATTATGGTTCCACATACACATTGCAGTTTTGTGGGTAGGTTGTTCTTGGCAAAGCATCGCTCTCTTCCTTTCATGCCAGGCCCCGCATGAGG GCTTACTCTGGGATTCCTGAGATGTTCGATCTTAACCAGTAACTCTGCTAGTTGTGAAGAAATTCGTGTAGGCTCTTGCATGTAGAGGCCGAGAGTGTTACTCAGCCAAGAATGACTTGCCCGCATACTGTTGTGGATTATGGTTCCACATACACATTGCAGTTTTGTGGGTAGGTTGTTCTTGGCAAAGCATCGCTCTCTTCCTTTCATGCCAGGCCCCGCATGAGGACGCCATGATTATGCTGATCATAACGTATGAGAAGTTGCTCTCCATATTGCTGGCTTTGCAATGCTATTAGGAACGTTTCCTCCTCCTGTTCACTATGCAAGTCCTGGCTGCCCTTTGGTTCAATATAGATCCCTGTGTTTGCTTGGATTTATAATGGCAGGAAGTATCTTCCGATATTTGAATATTTACAGATACAAATAATATCAACGGCCAGTCACAATGTCGCTGAATTCAATGAAGGGCTTCAAGATTTATAGTAAAGTTTCTAGCACGGCATGCTTGTACAGTGATATTGAACACGGATTTCTGCAAATCTTCTAAATTCAATTTTTCAATTTGTTGAACATCTTTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2 0 5' arm Picea_engelmannii_x_Picea_glauca mirnest 100 100 -75.3 .(((((((.((.(((.(((((.(((((..(((((((...((..(((((((((((((((((((((.(((((.(((...((((......))))..))).)))))..)))))))))))))))))))))..))...)))))))..)))))))))).))).)).))))))). (-75.3)