mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATTGAGTGCAGCGTTGACG TTAACCCTGCACTCAATAGTA CTTGCTAGCCGTGGCAACCACATCATTGAGTGCAGCGTTGACGATAGAAATTCCACCAATAGATTTGATAATATCTATCTATTTGTGGAATGCCATTGATATTGTTAACCCTGCACTCAATAGTATGTTTGCCAATGGCTCCAT GTGTTGTTGTAACGCAATATCGCCTGTTGTTGCAAGGCACCCATATTGATCTGACTGGTATTCAAAGAATGGCCAAGCAAGCGGTTCTTGCTAGCCGTGGCAACCACATCATTGAGTGCAGCGTTGACGATAGAAATTCCACCAATAGATTTGATAATATCTATCTATTTGTGGAATGCCATTGATATTGTTAACCCTGCACTCAATAGTATGTTTGCCAATGGCTCCATGTACTATCTTCTTCTTCGCATTCATAAATTAAACAATCTGGCCGCCATTACAGAACTGTATCGAACAGGGTTGTCTAACTTGGAGAAGGCGAGTTCTCGTAATTGAGCTCAGGGTTTTCATCTTGAATAAGTTGAATTCTGTGGTGGCATGTGATGTTCAAATGCCATGAAGAAGAAGATGATGTTCAGTAATAAAAATTTAAAAATTGTAATTTATGCCATATTAATATTTTGTTGTCATTTGCATTATACTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2 0 5' arm Picea_engelmannii_x_Picea_glauca mirnest MIR397 0.0005 pab-MIR397 4e-72 -59.7 ......((((.((((((.((.((.(((((((((((.((((((((((...(((((((.(((((((..(((...))).))))))).)))))))........)))))))))).))))))))))).)).)).))))))..)))).... (-59.7)