mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGGCTTTCTTGAGCTTCTTA GGAAGTTCAAGAAAGCCGTGG CCTTTAATAATTTCCCACGGCTTTCTTGAGCTTCTTATGCGGATCTGTTGGCGGTGAGATTGACCGCCAACACTGCCGATCGGGAAGTTCAAGAAAGCCGTGGAAAAATATGACAG TTTTTTGACAAATAATCTCACAGCTTTTCAAATGAAGGAAATGTCCTTCTGGGCGAAATTAGCAGTACATCTTGACTTTCTACATCTGTGCTACAGAAAGAAAGATTTGAAGCATTTAAAGAAGAGCGGATAGCTAAAAGTTAAATTAATTCAAGCTTATGACAAGCAAATTAACAGGTACATGGATTGAAAGATGGAAATTTGTGTATCATAATGACAGGAGAGGTAAGGAGAGAGGAAATCAAAAGTTATCGGTACAGGTTTATTTTAATCTGAGAAGCTACCTGCATAAATCTATCCATTATCTTAATCCTGGATCTTGGATCTAATGAGCATCCAGATCTAATAAACATCCAGACTCCAGAGTAATCAAAAGAAATATAAACCTAATTCTTTTGTACTTTAAAGATCCAAGGACGTAACATATTTACTAGCTATTCCCGGAGCAATAAACATTGACATGGACATTTATGTTCATGAATTCAAGGATTAGCTGAGATGGGCCTTTACTGCACCCCCAGGCCAGATCAAAGATCGAGGAGATCATCTCTCACATAAAACTTTAACAGCACATTCAATCAGAGCAGCAAATAATCGAAGATATTTAAAACTAAAGATTACGTACAGATACCTCATCCGAGTGCCTGGTATAGGGTTATATTATGGATCTGCAAACTGAAGTACCAAGTCGGATCACAGCAGAAGCAATAAAATTGAATCCCTTTAATAATTTCCCACGGCTTTCTTGAGCTTCTTATGCGGATCTGTTGGCGGTGAGATTGACCGCCAACACTGCCGATCGGGAAGTTCAAGAAAGCCGTGGAAAAATATGACAGTATTCTCCGGTTTAGCGTGCTGTTAGATAAAAATCTTCCCCAATTCTTCAACTGCGCCCGATAAGACGACATTCGGCGGGACCGAGGACTCGTCTCTCTTTTCTTATGC 1 0 5' arm Picea_engelmannii_x_Picea_glauca mirnest MIR396 0.000002 pab-MIR396c 5e-34 -57.6 ......(((.(((.((((((((((((((((((((((...(((...((((((((((.......))))))))))...)))...)))))))))))))))))))))).))).)))..... (-57.6)