mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCATCGGGGGCGTAACGCCC GCTGCTCCCCTTGTTTCTC TCTCTTCGACATGGCTGCTCCCCTTGTTTCTCTTGTCAATGATTAGAGGCATCGGGGGCGTAACGCCCTCGACCTATT GGTTGACCCAAAAACGCACCAAAAGCCTTCACATACATAGTTGATGGAATAATATTAGTCCTGTAATCTATTGCGATACGGATTGAGCAGCTTTGAAGTTCAAGAAATACTCTACAAGGTTAGACTAAGTTATCCCGCTGCAACATAAATTGAGCAGCTTTAAAATTTCTAGTTTTAACAAAATCTCCAAAAAGATGTTACCAAACCAACTATTAAGCATATTGCGCAATCCCTCTAATTACACAATAGCATTTGCTGCACTGGCAATTCTAGGCCACAAATCAGCACACTCTTTCCCAATGGGCCCTGTGATAGCAGAACCTTTCATTTCTCCCTTTGGATTTACTATGACGCCCGCATTATCTTCGAAATACATATAAACACCGTCCTTTCGGCGCCAGGGCTTCCGCTGGCGAACAATGACGGCAGGCATAACCTTCTTTCTGAGGTCAGGCTTTCCCTTCTTGACAGTGGCCATGACCATATCCCCAACACAGGCCGCAGGAAGCCTGTTGAGACGACCCTTGATTCCCTTCACAGAAATTATGTACAAGTTCTTGGCTCCTGTGTTATCTGCACAGTTCACCGTGGCTGCCACTGGCAGACCCAGTGACATCCTGAACTTGTTACCCGCGCTACCTCCACGACCTCTCTTCGACATGGCTGCTCCCCTTGTTTCTCTTGTCAATGATTAGAGGCATCGGGGGCGTAACGCCCTCGACCTATTCTCAAACTTTAAATAGGTAAGACGGTGCGGCTGCTCCATTGAGCCGTGCCACGGAATCGAGAGCTCCAAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAAAGTCGAGTTACGGTGCCAAACTGCGCGCTAACCCAGATCCCACAAAGGGTGTTGGGTGATTAGACAGCAGGACGGTGGTCATGAAAGTCGAAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCTGGCGAATCAACTAGCCCCGAAAATGG 4 2 3' arm Picea_glauca mirnest 100 pta-MIR1310 0.0000002 -25.1 .....((((...((((((.(((((.((.(((((.(((...))).))))).)).))))).)))..))).))))...... (-25.1)