mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGATTGGAGTGGAGTGGATT TTTTCTCCGCTCTGACGAT CACTATTATGGATTTTCTCCGCTCTGACGATCTCCATCTACCTGGAATTGTTAACCCTACTCAACTTGCTGCCTGGATGGGATTGGATTGGAGTGGAGTGGATTCTGATGGAT TGAGCATGACCACCTAAAATCCTCAAAGGAAAAGAAGAGGAAGATTGCTAACTGGAAGTTGGCGTGCTATTTGGCGAATGAGTATATGACAAACGGCACTTTACTGGGCAGGAGAATAATGGACCAGCAGCAGCACCAAGATTGCAGAAATGGCAACAGGCCAGTGGTCTTGGAGGTTCCTCTTCCAGATACCACCGAGGAGATCAGAAAGCAGCAGCAGAAGGAGAAACAAGGTATTATTATTTATTCCACTATTATGGATTTTCTCCGCTCTGACGATCTCCATCTACCTGGAATTGTTAACCCTACTCAACTTGCTGCCTGGATGGGATTGGATTGGAGTGGAGTGGATTCTGATGGATGATTTACACGAACATTTCAGTTCAATTTTGACATGAATTGTCCATAGGCTGTTGCGCCATGTGATGCCTCATTAATTGTTTTAGGTTGTAGAAAATGTAAATGTCTATTAGGGGCTTTCTTATTGAAAAGAAATATTTGGGGTTCACATGGAGTCTAGTCGAGTCTGTCAATGTGGCCATCCCTGTTTTTAACAAGTAAATAGGGTGTCTGGTGGGAATGGAGATGGGATGGATGCAGTGTTTTGATACCAATTAATAGGCTGTTTGTTGTTTGCACTATTGCATCTTAAGTCAGACCTCTCTCTGCAATGAATGAATAACATTGACTGTTTTCTGGCCCAAAAAA 2 2 3' arm Picea_glauca mirnest 100 100 -36.1 ..((((((.((((((.((((((((((.(((((.(((((((..(((....(((..........)))...)))..))))))))))))...)))))))))).)))))))))))).. (-36.1)