mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACAGAAGATAGACTTTGGTC CCAGAGTCCATCTCTGTCAG GGCAAAGGTGTCTTGTTTCCAGTTGTTTCTTGACAGAAGATAGACTTTGGTCCTATGGAGAAACAGCCTTCGCGACTTCCTTTTTATTGATTACTCCTATTTCATGCAGTGGTAAGTAACAAGAAGGGCAAGGTTAAGGGCAAGTTTCGCCATATCAGGTGACCAGAGTCCATCTCTGTCAGGAAACAAGGATCAAGTAACAAACACTTG TGCTTCCTGGCTTTACCCCTCTAAATCTCTATTCGTGGCCGCAAGGCTGTTTGTTATCACAGAGGTTGAACATTCAACTTGTACAAAAATTGCAGGAAGCATCCACTTGGGGCCATAGCCTTGTCAGGCAGTGAAAAGCCTTCACATGGTTCCAGCAAAAGGGCAAAGGTGTCTTGTTTCCAGTTGTTTCTTGACAGAAGATAGACTTTGGTCCTATGGAGAAACAGCCTTCGCGACTTCCTTTTTATTGATTACTCCTATTTCATGCAGTGGTAAGTAACAAGAAGGGCAAGGTTAAGGGCAAGTTTCGCCATATCAGGTGACCAGAGTCCATCTCTGTCAGGAAACAAGGATCAAGTAACAAACACTTGGATGCTTACGAGCGTAAAACTGAAGTTAATACGAGGGTTCCTCCTCAGGCAATTCCTGCCCTCCCTCAAGGGGATTAAAATGAAGGTCCTTGAAAGGTCTTGATCATATGCATGCTTCTGAACAGAGCTACAGGAGATCAGGACCTAAGAAAACATCTTAACCTTGAGCCTTTTATAAAAGTGGACAATACCAAGGAAATCCCAGAAGAGGATGAGATCCAGCAAAGGGCAGTGGTCAATGAAGACTGTCATCAATGTAATCATCCGCAGTTAGAGTATTATACCAGACAGTTACGGTCTGCAGATGAAGGGCAAACAGTGTTTTATGAGTGTCCAAATTGCCACCATAGATTTGCACAGATTACTTGAACTGGGCATGTCATATTTTTACGATCGTGGTTCCTCTTACTGTAGATGACTTTCATTAACAATTAATTTTTTGGGTGGCTGGAAACTCAGTGGGGTTATGATGCATTAAGTG 1 1 5' arm Picea_glauca mirnest 100 pab-MIR3699 4e-30 -74.4 .....((((((((((..(((..(((((((((((((((.(((.((((((((((((((((.(((((.(((((...((((((((((((.(((.(((((.((.........)).))))).))).))))))))...)))).)))))..))))).))))....)).)))))))))).))))))))))))))))))))).))))......)))))). (-74.4)