mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTA GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA GCGATGAATCCCGCCATGCTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTAAGAGTCGATCGGATCCGGTCAGTTCAGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGGGCGGATTCGATG GAGCAGGAGGTCGAGGGGTCGGGTCCTGCGGCCCTGTGTTTTTCAGCGTTCTGAGCTTAAATTTAGCTCCAGGATCCCGGCGTTCTGAGCGTTCTGAGCTTAAATTTAGCGTCTGAGCGTTTCGGCGATGAATCCCGCCATGCTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTAAGAGTCGATCGGATCCGGTCAGTTCAGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGGGCGGATTCGATGATCTTAGTACCGATCTTCGTCAGCGAGGCTCACGAATGGCGGAGGGGGAAGAATCGAGATCTTACTTTCTTTATTTATAAGTCTGGCTATTATTAGGCAGATTGCATGGCCGGATCATCGTCGATCTCGCTTTATGACACGGCCCGGCCCTGTCAATAGTACGTGCGGACTATCCGGTCGTCGACGGGTGTTAATCCCTGCGCTTCAATAATGGAAGCTTATCATCTTCTGGAGATTCCTGCGTTGGTTCCTCAGAATCCGTGCGTCTCTGCGCCTGTCGACGGTGAGAATCCGGTTTCCATTACTATCCGAGACGTTGAAATCGCTGTCTCTTTTATACTGTTAATTCAATGGCGGACGGAGCACCGAATTGCTGTTAATTCGGCTGTTTCGCCCTGTAAAACTCGGGGCGGCTTGGAATTGAAAGGGGAAAATAAGATTGCAGCTTTTGCACTACGATTTTCCTCCAATTTTCTCCGACTCCGGGTGGATTGTATTTCTTATTTTTTATTTCTTCTCCTGCCAATCCTTTCACGTGTGGGCCTCTGTGCATAATAGATCTCTGTGAATCATTTGATACTGTCCTTGGAGTCCCTGGATCTACGTCTGTGTTCATCATAGTAGCCATGAT 2 0 5' arm Picea_glauca mirnest MIR396 0.0000001 pab-MIR396a 6e-52 -46 ....(((((((..(((((...(((((((((((((((((.((..((((.(((((....))))).))))..)).)))))))))))))))))...)))))..)))))))... (-46)