mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGTTTGGTTGATGAGAACT TGTTTATCAAATGGACAGAAT AAGTCTGAACAGTGTTTATCAAATGGACAGAATCAAGCCAGTGCGGCTGAATTCCAGTGTTTGGTTGATGAGAACTGTGAGTTTG ATTGAGTTACATGATTCTGTAAATAAGCCAAAGACGAAGCTTGAAGTACCCTGTTTGGTTGATGGAGATGATGGGGTTGAAAATCATTTTGTGGGGAATGAGGTTGAATTACCCTGTTTGGTTAATGGAGATGATAAGGTTGAAGGAGATTTTGTGGGGAACAAGCTTGAATTACCCTGTTTGGTTAATGGAGATGATAAGGTTGAAGGAGATTTTGTGGGGAACAAGCTTGAATTACCCTGTTTGGTTAATGGAGAAGAAAGGATCGAAAGAGATCTTGTTGGGGACAAGCTTGAATCACCCTGTTTGGTTAATGGAGAAGAAAGGATTGAGAGAGATCTTGTGGAGGACAAGCTTGAGTCACCCTGTTTGGTCAATGGAGAAGAAAGGGTTGAAAGAGATCTTGTAGGGGACAAGCTTGAATCACCCTGTTTCGTTAATAGAGAAGATGGAGCTGAAAGGAATTTAGTGGGGAACAATGAACTGGAGCAGAGATCACAGCTGGTTGCTGAGGTTCGGGAGATCAATTCACCAGAGTTGGTGACTGGGAATGATGAGAAGTCTGAACAGTGTTTATCAAATGGACAGAATCAAGCCAGTGCGGCTGAATTCCAGTGTTTGGTTGATGAGAACTGTGAGTTTGAATCTCAGAGTATTTCAATGGAAGAACAGAAGCTTGAATTATCGCCCTCAGTTGATGTGACCTGCTATTTAGAAGAAACAGAGAGTATGGTGAGTGAGGAGAACAAGCTGGAGGAGAATTGCGAATCTCAATCCCAGAACTTGGAAAATGAGGATGATGCATGTGGCCATGTAATAGATGAGGGGAAGCAACCCTGACCTCTTTTTGTGTTAAATGCAGACAAAGGGCCTGCATTGG 4 0 3' arm Picea_glauca mirnest 100 100 -25.5 ........(((((.((((((((.((((((((((..((((.....))))..))))...)))))).)))))))).)))))....... (-25.5)