mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTAAATGCCTTAAATTCCCGA GGGATTTAAAGCATTTGAAGT AACTGGCTTAAATCCAAGAACTTTAAATGCCTTAAATTCCCGATAAATTCAGGCGATGACCGAATATATTTCGGGATTTAAAGCATTTGAAGTTCTGGATTTATCCCAAAC TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAATGAATAGAGATATAAGACTTGCTGTCACTGAAGTGATTTTCCTACAAGTGATCTAACTTACAATGTTCAGTAATACAAAATGCATGCTACACCCAGGAATAGCATTGAACAAATGGCTCAAGGATAACGAGTGAATCTATGGAATTATGAGCCTTTTCCCTGGGAAGAAACAGGTGCCTTGAACAGGCCCTGCAATAGCTCAGGCATTAAATATATTTCATTTTGTTTCTGATCTACTTGTCCTCAATCACACTTGATATTCCGATAAATTCTTCTTACAAATAATGTTGAGCCCAAGTAACCAACAGCCCCACAAAGGATGCCTAAACCAAGGCAGAACATTAGAGTGTAGCCAAAATAGAAACTGGTCTGGAAAAATCCAGACATCTTTGTCTTCATGTGGTAATAGTATATGGAATAAAGATACACATAGGCAGCTGTTGATGCAGCTGAGAAGAATGATGTCCATTGCCAGTGATAATTTTCAGCATTAAGCAAGAAGTATGTTCCAACAATTCGCCCTTCTCTATACTATGGCCCATAGGGTTTTTTTCTATTTACACGCCCTTGTTCCAGGGTTTGATTCTCGTAAAAATGGCGTGAGCCTGAACAGCAGAGGCAGCGTATATACGCCAACAGATCAGACCACTTCAGGAGCCGAGCAGAAACAACTGGCTTAAATCCAAGAACTTTAAATGCCTTAAATTCCCGATAAATTCAGGCGATGACCGAATATATTTCGGGATTTAAAGCATTTGAAGTTCTGGATTTATCCCAAACAGGAGCGCAAACATGCGATTATATGCCATCCACGGTAATACATGCAAAGAGAAGGAGAGCATCGACGGATGACAGGGGAAGGTCCA 1 1 5' arm Picea_glauca mirnest 100 pab-MIR3709b 1e-49 -41.6 ...(((..((((((((.(((((((((((((.((((((.(((((((.((((.((......)))))).))..))))))))))).)))))))))))))))))))))..)))... (-41.6)