mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGGAACCTGATGGGCCTCCA GGGAACCTGACGGGCCTCCAA GCTCCACTCTGCAGGCGCTCCCAGACTCCGTGGGGAACCTGACGGGCCTCCAAAGTCTCGACTTGCTCCGGTGCTCCACTCTGCAGGCACTCCCAGATTCGGTGGGGAACCTGATGGGCCTCCAAAGTCTCTCCTTGAGCTACTGCTCCACTC TGATGGGCCTCCAAAGTCTCTCCTTGAGCTACTGCTCCACTCGGCAGGCGCTCCCAGACTGGGTGGGGAACCTGACGGGCCTCCGAAGTCTCGACTTGAGCGAGTGCTCCACTCTGCAGGCGCTCCCAGATTGGGTGGGGAACCTGACGGGCCTCCAAAGTCTCTACTTGCGCTGTTGCTCCACTCTGCAGGCGCTCCCAGACTCCGTGGGGAACCTGACGGGCCTCCAAAGTCTCGACTTGCTCCGGTGCTCCACTCTGCAGGCACTCCCAGATTCGGTGGGGAACCTGATGGGCCTCCAAAGTCTCTCCTTGAGCTACTGCTCCACTCTGCAGGCGCTCCCAGACTTGGTGGGGAACCTGACGGGCCTCCAAAGTCTTGACTTGAGCGGGTGCTCCACTCTGCAGGTGCTCCCAGACTCCATGGGAAACCTGACGGGCCTCAAAACTCTCGACTTGCGCTGGTGCTCCACTCTGCAGGCACTCCCAGATTCGGTGGGGAAACTGACAGGCCTCCAAAGTCTGCAATTGAGTGGGTGCTCCAATTTACAGATGCTGCCAAATGTTGAGCATTTGAGCTCGTTGAAGATTCTTGATGTGTCTAAAAGTCCCAAACTGCAGTGGGGTGCGG 3 2 3' arm Picea_glauca mirnest 100 pab-MIR3710 0.000000000000008 -43.3 ..........((((..((((..(((((...(((((..((((.((((.(((((.(((((.(((((((...((((...))))..)))))...))..)))))...)))))..)))).)))).))))).)))))......))))..))))....... (-43.3)