mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGAGTGGGAGTGGGAGTGGG TGCTCCGATTGCCGCTAATGA GAAGAAACCTTGGGAGTGGGAGTGGGAGTGGGAGCCGGAGCGAAGGAAGGAGAACGGGCAACGATCGAGGGCCCCGGAGAGGCTGGTGTCGGTGCGGGGGCGCCGTGACTACGGTTTCGCAGAGACAGAACCACGATAATAACCTTCTCTCCCTTCTGGCAGTTGCTCCGATTGCCGCTAATGAAGTGAAAG TTTTTTTTTTTTTTTTATAAGAAAATATGATCCAGATTGCACACAGTTGCTCTACTTACAGAAAAATTACCCATAAAACAATATAAATGCTGTGAGATCACGCATAAAATACATATACACGGAGGTATATACCTGCATGTACTTACTACTAATAAGCAGTGAGGATTTTGAGAGCTAAGAATAGAAGTGGCATCACAAGGTTCAGCGCAGAGACCGGTGCTGGAGGAGATGCACTCGGCGGGGGCGCAGAGCCGGTGGGCGCATTTTGCGAAGCCGACGGAGTCACCGTTGACGGAGGAGACAGGGATGGAGATGAGGACGGAGTCGCCGTTAACGGGGATGGAGGAGACAGGGCTGGAGAAGACGACGGAGATGAAACGGGGACGACAGGACTCGGGGACGACGAGGGAGCTGGAGAGGAGGACGGAGATTGAGAGGGGACGACAGGAGCCGGCGACGGAGAGGAAGAAGAAACCTTGGGAGTGGGAGTGGGAGTGGGAGCCGGAGCGAAGGAAGGAGAACGGGCAACGATCGAGGGCCCCGGAGAGGCTGGTGTCGGTGCGGGGGCGCCGTGACTACGGTTTCGCAGAGACAGAACCACGATAATAACCTTCTCTCCCTTCTGGCAGTTGCTCCGATTGCCGCTAATGAAGTGAAAGGGGCCGTAGCTAGGTAATTTGACGACCGTGTTCCCGCCTTTGTAAGACGCAATTGGGCTCGACGTGTTGCAGGCGTCGTACTGAGGCGCTGTAACTTGCAGAACGGAGTCCTCGGAGGGATTGTAGTTGAACAAGAGCGTATCCC 5 0 5' arm Picea_sitchensis mirnest 100 cre-MIR1171 0.0006 -58.4 ......((.(((..(((((.(((.(((((((..(((((((....(((..(((((.((......((((.((...((((.....))))((((..((((((...(((((....)))))))))))..))))...)).)))).....)))))))))).)))))))..))))))).))).)))))..))).))..... (-58.4)