mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTCGCCTGGTCGTTGTGGG TACAACGGCCAGGCGACATTG GATATGGCGAACCAGCTTCGATGGGTTACTGCAATTGTCAGCCTTGCGTTGCTTGCTGGCGTGCCTTTCTTTCAGCCCTCATTGTCGCCTGGTCGTTGTGGGGGGTTGATGATCGTTACTAGAAAAGTGAAGTTTTCTAGTAATGGTCATCAAGCTCTTACAACGGCCAGGCGACATTGCGGACTTAAACAACGGCACGCTAACGAGCAACGTCAGGTTGAGAATTGGAACCCCTCTAAGCCTGTTCTCCACATCTT GCACGAGGGGTGATCTGAATTGTTTCTTCCCCGGCCACGCATTTGATATGGCGAACCAGCTTCGATGGGTTACTGCAATTGTCAGCCTTGCGTTGCTTGCTGGCGTGCCTTTCTTTCAGCCCTCATTGTCGCCTGGTCGTTGTGGGGGGTTGATGATCGTTACTAGAAAAGTGAAGTTTTCTAGTAATGGTCATCAAGCTCTTACAACGGCCAGGCGACATTGCGGACTTAAACAACGGCACGCTAACGAGCAACGTCAGGTTGAGAATTGGAACCCCTCTAAGCCTGTTCTCCACATCTTTAGAATTACAATCTCGAAGACTCTGAGCCGTTCATCTACAACTGGAGACAGAAGTCAGAGGGCAGGAATGGTAATGATCAGAATGATCAAGATAGCGGTTATCAACGTCATATTGCGCGCCAAGTAGAAGTATATGAAACGGAAATCGGAAATAGAGGATCGAGAATATCATTTACGCAAAGGAAGACGAGCACAAATTTCATTCCAAAAAGGCAAAATACAGTATAGATCCATAGAAGCATTGGGCTTATTAGATTGTGTTCAGGATCAATTTTACTATGAGAAATGATCTTGAACTCTCAGCTGAGAAGATATTTCGATTCCTGGGTTGCACTCGTTTGTTTGAGTACTGGGTACTTTTTCTGAACACTATGTTTTGTTGGGTCAAAATAAAAAAATATATATATATACAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 5' arm Picea_sitchensis mirnest 100 pab-MIR3695 1e-58 -139.6 (((.(((.((((..((((.((.(((((....(((((.(((((((.((((((((((.(((((((((.((.(((.((.((.((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((......))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))).)).)).)).))).)).))))))))).)))))))))).))))))).))))).))))).)).))))..)))).))).))).. (-139.6)