mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGCCAAGGATGACTTGCCT GTAAGTTGTCCTCGGCTAAAT GTTCATCTGTGCGCTTGCATGTAGAGGCAGAACTATTTATTCAGCCAAGGATGACTTGCCTACACCTTGTTATAGGTATCTGCTAGTTATGCCGATATTGATTTCAGGTACCGGGTAAGTTGTCCTCGGCTAAATATTTGTCTCTGTATCTTATGCCAGACCTCAGATGAGG GGTGAGATTGAAAACGATTCTTGTGGCCCACATGCATATTGTTGGATAAACCATTTGAAATGGCCGAAAAGCCATGTTTCCTGCAAATATGGATTCGTTTTTCTCGGTTCGGATAGCATTCGGGAATCTGCTTGTCTTATAAATGTCAAATGGGATTTTGCTCCATTTGTTTGTAATCATCCCAGTGTGTGCTTGGAAATGTAATAGTATGCGAGCTTCGTGGATGGAGCAGCGTTCGGTTTGTGTTCATCTGTGCGCTTGCATGTAGAGGCAGAACTATTTATTCAGCCAAGGATGACTTGCCTACACCTTGTTATAGGTATCTGCTAGTTATGCCGATATTGATTTCAGGTACCGGGTAAGTTGTCCTCGGCTAAATATTTGTCTCTGTATCTTATGCCAGACCTCAGATGAGGAAAAGCTCCAATTCGCCAGAATGTATGTATCAGTTCTATTTTCTTATTGAATTTGAACAAGCCATACTTCAGGTTTGTGTTTTGTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAA 2 0 5' arm Picea_sitchensis mirnest MIR169_5 0.0002 sbi-MIR169c 0.000009 -61.2 .((((((((....((.(((((.(((.(((((..((..((((.((((.((((((((((((((..((((.(..((.((((((.((.......)).)))))).))..)))))...)))))))))))))).)))).))))..))..))))).)))))))).))....)))))))). (-61.2)