mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTCCCTATTCCTCCCATT TGGGAGGATAGGAGAAGGCT GCACGAGGTTGAGGATTGGGAGGATAGGAGAAGGCTGTTTGCTTAATTCTCAGTTGAAACCTGATTAGTCTTCCCTATTCCTCCCATTCCTATTGCCTCCATCACACA GCACGAGGTTGAGGATTGGGAGGATAGGAGAAGGCTGTTTGCTTAATTCTCAGTTGAAACCTGATTAGTCTTCCCTATTCCTCCCATTCCTATTGCCTCCATCACACATCCCTTCACAATGTAACACAGTACAATTGAAGAAATGAATATGGAGAAATGATCATCCTGTTTTGCGGGTATTAAAGGGATGTCCTGTAGTTTTAAGGCCATATGGTCTCTGTGGCTTGGAAAGACCCACGCAGTAAATTACGATCTGATATACTGTAACAGTTTTCCCAACTTCACCGAAACCCATGGCCTTCTTCACTACACATTCCTATTTTGCCCGCTCTGTTAACTCTGGCGCCGTTACTCTCCAGATCTGCTCACATGGCACAGGGGACATGGATCTTATTATTCCTGTGACCAAGATCTGGATGTGGGTGTATGTATGGCTTGGATGTTAGAACAAGCATTAGTTCTGTGTTTTCTTTCTCAAAGTACCATGTAATTACTGGAGAGAAATCAATTGATAGATTGTATGAATAGGTTGGAAGTAGGAATGACTGTTTAGAGAGGATTATAGAGTATCTCCATATATGTTGTAAGAACCTTTATGCTAAGGTCTCAACATATCATATTAAGCTGTTGACATTACTAATAGCAGATATCAAGTTCAGCCAGACGAGAATGTCTCTGGCGATTTCGATTTCATTTTTAATGGTTGCTCTTTTGTGTGCAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 2 3' arm Picea_sitchensis mirnest 100 pab-MIR482b 6e-52 -41.3 ....(((((..((((.((((((((((((.((((((((.(((.(((((.....)))))....))).)))))))))))).)))))))).))))...)))))......... (-41.3)