mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGATTGAAGGGAGCTCCT GCGCTTCCTTCAACCCAATAA AAAGAAGCAAGAGCTGACGGGGCGCTTCCTTCAACCCAATAAATGGCTGTGTAGGGATGATTCAACTGCTGGTTCATGGATTCTATTACATTGTCACGTTGCTGGAGCTATTTTTCGTGGCAAGATAATGGTGTGCATGGCACAGGAGTTGGAATGCCACTATGCGGCGTTATATTGGATTGAAGGGAGCTCCTCGCAGGCCTCGTGCTGGA TAGTATTGTGGTGTTATGTGGGTGTTTTGTGTGTGCTTTGGGTTTCAAGTTTTTGTGTTTCTTTCAGATTTTTGTAAGTCTGTTAGTACTGGGTTCTTTATCGTGTAATGTTGTTTTGTTGCCTTCAAGGCTCTGCCTGTGTGTAGCTTTTTATTGTGAGATATAGGATAGCTTGAGAATATTTATCGAGATTTAGGGGTCTATAAATGGAAAGAAGCAAGAGCTGACGGGGCGCTTCCTTCAACCCAATAAATGGCTGTGTAGGGATGATTCAACTGCTGGTTCATGGATTCTATTACATTGTCACGTTGCTGGAGCTATTTTTCGTGGCAAGATAATGGTGTGCATGGCACAGGAGTTGGAATGCCACTATGCGGCGTTATATTGGATTGAAGGGAGCTCCTCGCAGGCCTCGTGCTGGACCCAATAAAAGATTTGTATCAATCTTTCCTCCAGCTGGTTTACGTATTTTCGTCTAGTATTGTGTTATTGTTGGAATGCTTAGTAATTGAGAACGTACTACTAACGACTGTAGTGTGTAACAGCCCAGGATGAGGAATAACCAGAGTCCTTCAGGAAGATGAACACAACGCTGCATCACACATTTGTTTTATCTGCCTGACATTTGCACGCAAGACAGTTCAATCGATCGATGTAAATCTCCTCGATGTTCCATAACCGCCATTTTATGCTCAGACACGATTCATGCGTTCAATGTTTCAAGATTCTGTTTTCTGCTCCAAAAACACGATTCATGTGTTCATTGTTTCAATATTTCTATATATTCAAGTTTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2 0 3' arm Picea_sitchensis mirnest MIR159 0.0008 pta-MIR159b 0.0000000007 -81.8 .....((((.(((((..(((((.(((((((((((.((((((....(((((((((((.((.(((((((.(((..(((((.((.((((((..((((((((..((....)).......))))))))..)))))).)).)))))..))).))))))).)))).)))))))))....)))))).))))))))))).)))))..)).))).))))... (-81.8)