mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACAGAAGATAGACTTTGGTC CCAGAGTCCATCTTTGTCAA GGCAAAGGTGTCTTGTTTCCAGTTGTTTCTTGACAGAAGATAGACTTTGGTCCTATGGAGAAACAAGAAGGGCAAGGTTAAGGGCAAGTTTCGCCATATCAGGTGACCAGAGTCCATCTTTGTCAAGAAACAAGGATCAAGTAACAAACACTTG GGGGAGGTGCTTCCTGGCTTTCCCCCCTCTGAATCTCTATTCGTGGCCGCAAGGCTGTTTGTTATCAAGAGGTTGAACATTCAACTTGTACAAAAATTGCAGGAAGCATCCACTTGGGGCCATAGCCTTGTCAGGCAGTGAAAAGCCTTCCCATGGTTCCAGCAAAAGGGCAAAGGTGTCTTGTTTCCAGTTGTTTCTTGACAGAAGATAGACTTTGGTCCTATGGAGAAACAAGAAGGGCAAGGTTAAGGGCAAGTTTCGCCATATCAGGTGACCAGAGTCCATCTTTGTCAAGAAACAAGGATCAAGTAACAAACACTTGGATGCTTACGAGCGTAAAACTGAAGTTAATACGAGGGTTCCTCCTCAGGCAATTCCTGCCCTCCCTCAAGAGGATTAAAATGAATGTCCTTGAAAGGTCTTGATCATATGCATGCTTCTGAACAGAGCTACAGGAGATCAGGACCTAAGAAAACATCTTAACCTTGAGCCTTTTATAAAAGTGGACAATACCATGGAAAGGCCAGAAGAGGATGAGATCCAGCAAAGGCCAGTGGTCAATGAAGACTGTCCTCAATGTAATCATCCGCAGTTAGAGTATTATACCAGACAGTTACGGTCTGCAGATGAAGGGCAAACAATGTTTTATGAGTGTCCAAATTGCCACCATAAATTTGCACAGATTACTTGAACTGGCCATATCATATTTTTACGATCGTGGTTCCTCTTATTGTAGATGACTTTTATTTACAATTAATTTTTGGGGGGCTGGAAACTCAGCGGGGTTATGATGCATCAAGTGTTTTGGTTGCAAGGGCATTGATCTTTATCTTTCAATATTTAAACCAAAAACTGTGTAAGGTGATTTGTACATAACCTTTACAAGAGATTGTTGTTTTCTAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 1 5' arm Picea_sitchensis mirnest 100 pab-MIR3699 3e-30 -52.8 .....((((((((((..(((..(((((((((((((.(((((.((((((((((((((((.(((((.......((..........))..))))).))))....)).)))))))))).))))))))))))))))))))).))))......)))))). (-52.8)