mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTCTGATACCATGTTGAAG TCAACTTTGTCAAAGCCCT TATACTGATCCTTCAACTTTGTCAAAGCCCTTCAACTTGCTTTGCTGCCTTTGTTGCAGTTGATCCTTGAATGTCTCTTTTTGTTGCCCTTCCTTTGACATCAACACCTTAGCTCTGATACCATGTTGAAGAATCTAAGG GATTCGCTGCTTCCTCGGGTGATCTTCTTCTAGGTCAAGGAGATGATTCTTTCTTGAAGATGACCATCCCTTATTGCCTTAAATATATTTTGCCTTCTTATAGGTCAGGATTGCTCCTAGAGTTTCAATCTTCTCCAAGATGATGTAATCTTTGTTTTTGAGGTCCTTTGAGCTACCTTACTTTGTATACAACTTGATGAGGGTCTTGATGGAATTTTGGTGATGATTATGGAGATAAAAGCTCTTGTTGTTGTAGACTGTCTCCTTGATTGCATAGACAAAAACCCTGGGTGATGTATACTGATCCTTCAACTTTGTCAAAGCCCTTCAACTTGCTTTGCTGCCTTTGTTGCAGTTGATCCTTGAATGTCTCTTTTTGTTGCCCTTCCTTTGACATCAACACCTTAGCTCTGATACCATGTTGAAGAATCTAAGGCAATTAGAGTTAATGAGATTCTTCTAGCATGACAATTGTTTGTGAGGTATTTTATTTTTTCTTCTTAGCACAATCTTAACTTGTTCTTATTAGAGTGTGTCTTATATTCATCAAATAGTTACCAAAACAAAGAGACAAGAACATAAGATAAGGGACAAGAACATAAGATGTTTGGCTTTCTGCCAGGGCCAAAACCTCTCACTCTTTGAGAGNGAAACCCACACAAATTCTTATAGAGAT 4 2 3' arm Pinus_pinaster mirnest 100 osa-MIR1873 0.0004 -23.7 ......(((.(((((((..(((((.(((...((((((.((...((.......)).))))))))...((((.((((.....................)))))))).......))).)))))....))))))).)))..... (-23.7)