mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
TCGGCCTCGAATGTTAGGAGA TTCAACATTAGAGGCCAATA GCCCATTCCAAACGATAACATGTTAGTTAGCTGAAGAGATTCTTCAACATTAGAGGCCAATATAGAATCATATTCTTATTCTTAATCGGCCTCGAATGTTAGGAGAATGTTTTCCTCTACCTAAGCATGCTATCTCAATGGAATT CGGCCGGGGACATTTCCAGTCTTGTAGAATTACCTGGTTGTGTTATTTCATGATTAGGGTGATCTGCGCTTTTGACTCTAAGATAAGATGTTAGTTATGTGAAGTTCTTTGGATAAGATTTTGCGCCTTTCTGTATAAGATAAGATGTTAGTTATGTGAAGTTCTTCTTGGGATAAGATTTTGTTAGCTGAAGAAATTCTTGAACGTTAGGAGGATGATTCACCCTACTTTTTTAGGGATTATATGGAAAGGGGTATTCAAGAAATCCGTCAAACGATTAGGAGGATAATTGTCCCTGCTTTTCTAGGGTTTATGGTGGTGGGTATCCAAGGAATTCCTCAAAATTGGGAAAATGTTTACTTCTACTCTACTTTCTTAGGGTTTGAAGCTGATACTAATGCCTGATCGTCATGATCTGAGGTACAGGTTGATTGGCATGATCTGAGGTGATCGTCATGATCTGAGGTATAGGTTGATTGGCATGATCTGAGGTAATTGGAACGATTTGTGGTTAGCTTTGGAAGGTGAAGAGATTCTTCGAAGGTTAAGTGCCCATTCCAAACGATAACATGTTAGTTAGCTGAAGAGATTCTTCAACATTAGAGGCCAATATAGAATCATATTCTTATTCTTAATCGGCCTCGAATGTTAGGAGAATGTTTTCCTCTACCTAAGCATGCTATCTCAATGGAATTTACAGAGTAGTTGGCTGCGTGGAACCCTTTACAATATTTGGTAGTCAAATGGAATTCTGCCGAGTGGCTGGCTGCGTGAAACCCTCTGTAATATTTGGTACTCGAA 2 1 3' arm Pinus_taeda mirnest  100 pta-MIR1314 4e-60 -44 ....((((((...((((.((((((((.(((..(((((.(((((((((((((.((((((.((..(((((.........)))))..)).)))))).)))))).))))))).)))))..))).)))).)))).))))....)))))). (-44)