mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGATAGAGAGCACA TGCTCTCGTTGATTTTGTCATC TCGTGTCGATGACAGAAGATAGAGAGCACAACCGCTCAGATGCCGGCACTCTGCGTTTGAGGTGTATGTGCTCTCGTTGATTTTGTCATCAAATTA CGTCCAACACGGTAGGAGGTGCGGAAGCATATCTTGATCTTTTCCAGCACAATCGCTTGGTTATGTTTCGACAGATGCCCTAATCAGGCAGGAAATTCAACTATATTCAAGCCCTTGTGTTTCTGTATCGGAAGATGATGGGCATAAGGAAGTGTTCGTGTCGATGACAGAAGATAGAGAGCACAACCGCTCAGATGCCGGCACTCTGCGTTTGAGGTGTATGTGCTCTCGTTGATTTTGTCATCAAATTAAACCTTCAGCTTGTTAAGCATTTCATATCTGAAGTTCCTTATGTAGATCTCTATATTATTATCGGCATATAAAAATTTACTTCCCTTTGCAAGTTTTACCCCTTCTCCACCCACACAGAAACAGAGCAACAATACTTCGAAATATTTTATCTGTGTCGTAAAAGGAAAATGCCTGAATCGCGCCATTTACTTCCGGATTGTCCTTTCACGACTTAGTGTTCCTTTCTT 4 1 5' arm Pinus_taeda mirnest 100 pta-MIR156b 7e-42 -38 .......((((((((((....(((((((((((..(((((((((.((...)).)))))))))..)).))))))))).....))))))))))...... (-38)