mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTACGGGAAGCCAGGCATA CATGAGTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATATACGAAGCTTATTGAAATATCAATAACCTTTGTGGATGGCGTACGGGAAGCCAGGCATATTCCATT ATCTCAACCCCACAATATTCTTCCTTCTTTTCCTCTTCTCACCATTATTAGCCACACCTTAATCTTCAAACACTAGTTTTATGCCAATTCAGTAGGGTTTTTCTCTTGTGGGGCTTTCTAACCCTTTTGATTATGACCTACCTCTATATATCTATAGATCTCCCTCTCAAACCACAATATATACCTCATTCTCTTCTCTTCTTTCACTTCACATTTCTCATCTCATCACTCTCTTCCTTTCTTTCTCCCACCAAATCCACCCCCATCTTCTACAACTCCACCAAAAAAATTCTATCACCTATTATAGATTGAGTAGAGATTTATTAGGTTTTAATTTTGAATTTTTATTTTCACTCTGATGCATCTCATCATCATGCATACATGCATGAGTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATATACGAAGCTTATTGAAATATCAATAACCTTTGTGGATGGCGTACGGGAAGCCAGGCATATTCCATTTACATACATGGAGATCATCAGTAATAACATCAATATTTGATCTATACTCATTTTTCTTTTCTTTTTTAAAAATT 1 0 5' arm Pisum_sativum mirnest mir-160 3e-23 mtr-MIR160e 2e-27 -52.9 .(((...((((((((((((.((((((((((((.(((((((.(((((((....))))))).))))))).)))))))))))).))))))))))))..))). (-52.9)