mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTAGCCAAGGATGACTTGCCA GCAAGCATCCTTGCCTACTA TCTAGCAAAATGGAAGAAAGGTCTAAGACGAAGAAAGGAGTCTTTTTTGTGTAGCCAAGGATGACTTGCCACACGGCTAAGAGCCATTGAATTGGCCAAGCTAGCGGCAAGCATCCTTGCCTACTACATGACAAGCTTTTTTCTCGCATCGTAGATCTTTACTTCTCTATCTT ACCATCAAATGGAGTGAGAGCGTAGGTTTCTAGCAAAATGGAAGAAAGGTCTAAGACGAAGAAAGGAGTCTTTTTTGTGTAGCCAAGGATGACTTGCCACACGGCTAAGAGCCATTGAATTGGCCAAGCTAGCGGCAAGCATCCTTGCCTACTACATGACAAGCTTTTTTCTCGCATCGTAGATCTTTACTTCTCTATCTTTATTCATCTACTCTTCAAATGTGTGGGATCTCAATTTTCGTCATATATATGGTGCTCAAATTATGAAAATGGTGCACAAAAATCCAAAGTCGTTTACTTAAATAGTGTACAAGGTAAATGAACACAGAAATCCTATTTGTCTCTTGATTTTGGGCTCTCTCAAAACTTCATTTCATATATTTCTTCTTAAGGCCTTCTAATGATTCGAAAAGTCATACTCCCTCTGTTAGTTTAGTTATGATTTTAGAGAGTCAAATTGATTATTTTTCAAATTTAAATTTCACAACTTTTTCTTAGATTTTCTACCTCTGTTAGTTTCCACTACAATATTTTTTATATAATTAAACGTAGTTGTCTATTTTTTATAAAAAAAATTACAAAATTCTCAATTATAGAGTAAAAATAATAACTTGACGGANAAAAATCAGACGCTAACTCTNTTTACGGAGATGGCCAGGTGGTATTATATTTTGGGGAGAAGTCACATC 2 1 5' arm Barnadesia_spinosa mirnest MIR169_2 0.00004 osa-MIR169e 0.000002 -56.7 ...........((((((((((((((.(((((.((((((((.(((((.(((((((.((((((((.((((((....((((....((((......))))..))))...)))))))))))))).)))).))).)).))))))))))))))..)).))))))))).)))))....... (-56.7)