mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCATTTGCACCTGCATCTTG AGGTGCAGTTGCAAGTGCAGA TATCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTGTTGCGTTATCTGGTTCTGGTTCGTAAAAGCCAAAGCACAAGAAGAGCCAATAGCAGTCGGCAGATATGGTGGCAGCATGGAGTTATATGCATCAAGGTGCAGTTGCAAGTGCAGATGAATGCC AAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAAAAATGGTAAGTAGCTCTGCAGGTTCAGTGATAAATGGCCGTATATGATGAGTAGTGAGTGCGTAGGAGTACATGCCACAGGAACAGGATGCTAAGATGTATCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTGTTGCGTTATCTGGTTCTGGTTCGTAAAAGCCAAAGCACAAGAAGAGCCAATAGCAGTCGGCAGATATGGTGGCAGCATGGAGTTATATGCATCAAGGTGCAGTTGCAAGTGCAGATGAATGCCATTTTAGCTAGCTATTTGGATTTTGGCCTTGCGACGTCAGTGCTTAAGGTAAGTGTGATTCAAAAGAGATTTCAAGAACTTTTCAAACTCAAGACGGTCAGCATATAATTTTTAACAGTCCTTCCAAATCTATGGCTACCATTATTTTGAAGGCACAGACTCATGTTTATGTGCCGACGTTCATATTTTATAAAGTGTGGATTCACTCTTTTATATCGAAGTAAAAATCTTGAGTCACTCTTTATTTTGATGTGCCGGCTCTTTTAAGTGTTGTAAAGGCCCTTTTACATCGATGGTAAAATAAAAAATCCGCACCCTGAAATAAACATTTTCATTCAAGGTTACATTTAACTATATATTAATGGATTCCTGAAAAATAATAATCCACCTGAAAATAAAGAAAAGGTATGTGAGCTTCCTCGACTGACCACGAAAAGAAACCCCGCAAACAGGAGGACAGAACAAAACGCGCGCACAACAAGAACAGCCAGCGATCACCACCCGCCACCACAGAAGAACACGAGACCCAAGCGGCGGAACCCACACCGCACGCACCACCACCACCCGAGCCCACGCACCCACACAGCCCCGCGCCCGCGAGCCGCGCACCGCCCCCACCCCAAACCC 1 0 5' arm Poncirus_trifoliata mirnest MIR530 0.0000001 csi-MIR530b 3e-79 -57 .....((((((((((((((((.((((((((((.(((((..(((.(((.(((((......))))).)))...)))((..(((...((.((((.((....)).)))).)).)))..))..))))).)))))))))).)))))))))))))))).... (-57)