mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG AGCTTTTGAGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCACTAGAAAACCTTAATTTGATTTTGATCTTAATTTCTCCTTTTTTCTTCTCCGTGTGTGTTTGTGTACTCAATTAGTCAACGGATCCATGATCCATGATCTTTGTTGATTAATTATTATGAGTTTCAAATTAATGGCATCCGTCGTTTGAGTGATTAAATTAAGGAGTAAATCTGGATCATTATATAGGATCTGGTGTCATCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTCT ACTCACAATCTCTCTTTCTGTGTGAAGAAATATGAAAGAGGAAGCTTTAGCTTTTGAGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCACTAGAAAACCTTAATTTGATTTTGATCTTAATTTCTCCTTTTTTCTTCTCCGTGTGTGTTTGTGTACTCAATTAGTCAACGGATCCATGATCCATGATCTTTGTTGATTAATTATTATGAGTTTCAAATTAATGGCATCCGTCGTTTGAGTGATTAAATTAAGGAGTAAATCTGGATCATTATATAGGATCTGGTGTCATCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTCTTTCTTCCTTTCTTCGAAAACTGCCTACTAATTTGCATCTATCATAACAAAGATCTGATCTTTCAGGTGGGTTTACCAAATTTTGCCCTTAATTTTGACTTTTTTGGCTGATGATTGGAGTAATGATGAAAGATTTTGACTTTATTTGAAGTCTGCAAATACCACTAGAAAGATTTTTCAATCATTACTTGTTTTCTTTCTAGTATAAATCTGAAAAAGGGTTTTGAGTATTTTGTGGGTTTGAGTTTATATTGATTACAATTTGTCGGTCTCTAAAAACTCTTATTTTGCCATCAATAATCTGATCTGATCTCTTTTTCAACTTGATGATATGTTTTGACTGTAATATATTAGTCAATACCCATCATCATTACCTTTGTGATGACTGTATCTTTCACCTANGGTTTCCTTCTGCATGTTATGCTTTAAACATCA 3 0 3' arm Barnadesia_spinosa mirnest mir-166 0.00000002 ptc-MIR166a 0.00000000006 -74 .....(((.((((((((..((((((.((((...(((((((...(((.......((..((((((..((((((((((...((..(((.......(((((...((((((((((((((((((((.(((...))))))))..)))))))))).....)))))..))))).((((((....)))))).))).)).......)))))).))))..))))))..))..))).)))))))...)))).))))))..)))))))).))).... (-74)