mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCAGTCCCGAACCCGTCGG TCTGAGGGCTGGGCTCGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCGTCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCCCCTCCGGGGGCCTT AAGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCTCGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCGTCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCCCCTCCGGGGGCCTTCCCCGGGCGTCGAACAGTCGACTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCCTGCGGATGCTCACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTTTTTTTGTAACATGAACTTGCCGGAATTGAGGATTCAAACGTAAACTTCTACAACCTAACTCGGCCAAAGAATACATGCGTCAACAAGCTACAGGGTCGTCGCTTTCTAGTTGGTGATGTTGCGTGGAACCACGGGGAGAATTTGCTTGCGTCTGATATTTATGGCATCGTTATTATATGGAAGAAAGAAAAGACAAGACAGGTATAAGCGGAAACAATTCATTCACGCACTCTAGGACTAAGACTTCAGCTTTGTCTTGTGTCGTCATTCTTTTGTAACTGCTGAACCATTTTGTTGCATTATTTCTCCGATTCATT 5 1 3' arm Populus_euphratica mirnest 100 peu-MIR2911 4e-44 -74.4 ((((((.......))))))..(((((((((....(((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))).))))....)))))))))..((((((....)))))).. (-74.4)