mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTCCCTCAAGGGCTTCTA GAGGCCTGCTAAGGGAGAACA TGTCCAAAGCATCGATTGCTTGCTCTCCCTCAAGGGCTTCTAACGTTTTTGTCATGTGGTGCTCTTAATTATAAGAGTTTGTTATGAGCAATGTTAGAGGCCTGCTAAGGGAGAACAGATAGTCGGTGTTTTGAGA AAGCAAGGTTTCGAGACGAATGAAAACAGATGAAGTTTAAAGAAATTTGTCCAAAGCATCGATTGCTTGCTCTCCCTCAAGGGCTTCTAACGTTTTTGTCATGTGGTGCTCTTAATTATAAGAGTTTGTTATGAGCAATGTTAGAGGCCTGCTAAGGGAGAACAGATAGTCGGTGTTTTGAGAATCTGAAGAATGTCAGTTTCAAAACTGAGAGATAAGAAGACGACAATGGCTTACATTACTGACTCTCCCTCAAAGGCTTCGACATTGGATTCGTTGTAAGTCGAGGTCGAAGAGTTTGGGGGGAGTCAGTGATGCTTGTCATTTTCAAACAAAATTATTTGTTATTTTGTTCATTGCTTGTCGTGTGTTTAGATAACTGCTATAGAGATATATTTCATCTTCAATTTATTTTCAACATAATATATTTTATATGTTTGATTGTAATATCAACTCTTAGATACAAAAAATACTACTTCGTCCGTCCCAATTTTTTTTTCCACTTTGCCAA 4 1 5' arm Barnadesia_spinosa mirnest 100 aqc-MIR477b 0.00003 -57.9 ..((((((((((((((((.(((.(((((((...((((((((((((((.(..(((((....(((((((....)))))))....)))))).))))))))))))))....))))))).))).)))))))))))))).)) (-57.9)