mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATC TATTGGCCTGGTTCACTCAGA TCATGGTTTCTTGACATGAAAGTGTGGCTATGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACAAAATCATCTAGTTTTTTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTTCTCTTTCATTTTCATTTTTATTTA ATATCTCTCTTTAATCTTTATCATGGTTTCTTGACATGAAAGTGTGGCTATGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACAAAATCATCTAGTTTTTTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTTCTCTTTCATTTTCATTTTTATTTATTTATTTATTTATGTGACCTTCTATTTTTCCATTTCAATGAATTTGCTATTTTGTGTTCTTATGATTTTTTTTTTTTCAAAAGTTGAGCAAAGTGGTGAATTTGCTCAAATATGACACTGGTTTTGAAAACAAATAAAGATGTCTCGTAAAATACGGAAATGGGCTATTTTCGTATCTGTTTTTGATTTAACATTACACTTGATTAAATACTTTAATTGCGAAAATCTTTTCAATATTTTATTGGGATATTATAAAATAGTACTCATGTGATATTACACTTTTAAGTTTGGAAGTTATTAATTTCATAGATCACCATTATATTTTTATTTATTTATTCTATTTCAAGTTTCTGTTACTTGCTACACGTTTTTAAAAGCTATTTGGTGGATTAATAAATATTTGGTCAGTAACTAAAAAAACCTATATTTTTATTTATTTATTTAAAGATCTTTATATCATGAGACCTAGATNTTAAAAATGTTTTTATATCATTCAAGTTGTCTTTTGATGGTTTTTGAGTATAAAGTTATT 2 0 3' arm Barnadesia_spinosa mirnest MIR171_1 0.000000002 hvu-MIR171 0.00000000003 -38.8 ...........(((.(((((((...(((((.(((((((((.(((((((.(((((.((((...........)))).))))).))))))).))))))))).)))))..)))))))..))).......... (-38.8)