mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATTGTGGAACGGAAGGAGAA TTTCCTTCATTAATCACGGTCGT GGCATGGTGGAGATTGTGGAACGGAAGGAGAAATCATGTTTCCATCTGCTGAACCTAATTGTGCCAAGGCTAGGGTCATGATGGAGAAGGTTGTTTCCTTCATTAATCACGGTCGTTAGGCCCT CTGCATATGCGGAAGATACCGGCGGCGCAGGTCGGCGGAGCTGCTACTTGGGGTGCGCTAGGTGCTATTTTGTTGCTGCAGGATGGCTAAGAGACAGGGAGTCGTTACACGAGCACTGAAGGGGAGTGGTGGGTGGCATGGTGGAGATTGTGGAACGGAAGGAGAAATCATGTTTCCATCTGCTGAACCTAATTGTGCCAAGGCTAGGGTCATGATGGAGAAGGTTGTTTCCTTCATTAATCACGGTCGTTAGGCCCTTTCCTTTCCTTTCATGCTTTCCGTGCTGTATCTTTGAATTTTCTTCAGTAATTTGTATTTCATGTTAGAGTGCTGTTGTTCCAGAGATATATTTGTGTCTAGATGATTAATCTACTGTACTAAGTCACCAATCAA 4 2 5' arm Populus_tremula mirnest 100 100 -38.7 (((........((((((((....((((((((((((...((((((((...(((.((((.((.......)).)))).))).)))))))).)))).)))))))).....)))))))).....))).. (-38.7)