mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGCCTTGCATCAACTGAAT GGAAAGAGGGATTTTAGTTACCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTCTGCGATTTCATTGCCAGATGGCTAAACACGATTGGCTGTGAGGCAAATTATAAAAAGAAAGAGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCGGTGAAGACTCCGCCGCCGCCG TCACTCCTAAATAAGTAGTATATAAGTAGGGCTATTTACGGAAAATAAATTAAAATTATATTTTTGTAGAGAAGGAAAGAGGGATTTTAGTTACCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTCTGCGATTTCATTGCCAGATGGCTAAACACGATTGGCTGTGAGGCAAATTATAAAAAGAAAGAGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCGGTGAAGACTCCGCCGCCGCCGAAGCAGAGGCAGCAGCGTTAGATCTCTATAGCGTGCTCTTTATATCTCAATCAGATCTCAGGTCTTCTCATATTTTTACTACAAGAAAAGGAGAATTTTATTTTGATTTGATCACTTATAATAGATCTTGGCCCTCTTGTGGTTGAATCGAATACACTGTAGTTGTTCTTTGCGAA 3 0 5' arm Populus_tremula mirnest MIR168 2e-78 ptc-MIR168b 2e-68 -72.7 ((.....(((.(((...((((((.((((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((((((....((((.(((((..((((((((......))))))))..))))).((.....)))))).)))))))).))))).)))))))))).))))).))))))))))))))))).)))....)).... (-72.7)