mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCAGTCCCGAACCCGTCGG TCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCGCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCTCCTTCGGGGGCCTT CGGAGGACCGAGTGCCGACCACGCCCGGTCGTACTCATAACCGCATCAGGTCTCCAAGGTGAACAGCCTCTGGTCGATGGAACAATGTAGGCAAGGGAAGTCGGCAAAATGGATCCGTAACTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCGCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCTCCTTCGGGGGCCTTCCCCGGGCGTCGAACAGCCAACTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCTTGCGGATGTTAACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGA 5 1 3' arm Beta_vulgaris mirnest 100 peu-MIR2911 3e-39 -74.6 ((((...((...)).))))..(((((((((....(((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))).))))....)))))))))..((((((....)))))).. (-74.6)