mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTTGGCAGGTTGTTCTTGGC CAAGGATGACTTGCCGACGAC CCTTCCATGGAGGATCATAAAGATTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACGACTCGCTTTTGCTTTTGCTTCCATCAATATAGGCATAATCAAGAAGAGATGAATCCGTTGGCAGGTTGTTCTTGGCTACATTTTTCTTTCTGCTCCTCATGCCAAG GGTCCCATCTTTCTCCTCTATCTTCCCATCCTCCCCAGCTCTCCTTCTACGTCTGCAAATTAAGCAAAGTGTCCCTGTTTCTTGCTTCAGTTGCTGTAGTTTCACTGTAACAGCCTTCCATGGAGGATCATAAAGATTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACGACTCGCTTTTGCTTTTGCTTCCATCAATATAGGCATAATCAAGAAGAGATGAATCCGTTGGCAGGTTGTTCTTGGCTACATTTTTCTTTCTGCTCCTCATGCCAAGCTTATGGTGATTATCCTGTGAACTTGCAAGGATCGCCTTCAAGATCACTGCTTCACTGATATGAAAATCATATGGTAATGTAATATAATATCATCAACATGGAAATTAACCTCCAGTTGTTATCTTCTTAATCTCCCTCTTAATACATGGAAATCATGATTATCATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 0 0 3' arm Populus_tremula mirnest MIR169_2 1e-44 ptc-MIR169b 3e-42 -59.1 .........(((((.((.(((((..((((.((((((((((((((((((((((.(((..(((((.((.(((((..........))))).)).))))).))).......)))))))))))))))))))))).))))..))))).)).)))))........ (-59.1)